RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 PHACTR2O75167 634 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 LAMC2Q13753 1193 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM206Q9H813 350 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PPFIA4O75335 1185 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 STAM2O75886 525 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CYP2C9P11712 490 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PPARDQ03181 441 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MORN1Q5T089 497 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 KIF18AQ8NI77 898 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 LMO3Q8TAP4 145 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TRIM7Q9C029 511 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF233A6NK53 670 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PPEF2O14830 753 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CA12O43570 354 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SHCBP1Q8NEM2 672 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 JAKMIP2Q96AA8 810 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ITIH6Q6UXX5 1313 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PLXNB2O15031 1838 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MUC3AQ02505 3323 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CSPG5O95196 566 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MYL6P60660 151 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CYP24A1Q07973 514 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ELF2Q15723 593 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 DGKDQ16760 1214 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NFRKBQ6P4R8 1299 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 EFCAB13Q8IY85 973 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GPD1LQ8N335 351 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MS4A14Q96JA4 679 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CREBZFQ9NS37 354 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.12□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CITO14578 2027 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 HBP1O60381 514 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NFICP08651 508 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 RABGGTBP53611 331 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ASIC2Q16515 512 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ZFP42Q96MM3 310 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GPR88Q9GZN0 384 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 KCND2Q9NZV8 630 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.271e-8■■■□□ 15.3
CNIH1-201ENST00000216416 MMEP08473 750 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PPP1R2P41236 205 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NAMPTP43490 491 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SPA17Q15506 151 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ATF7IP2Q5U623 682 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MTHFD1LQ6UB35 978 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PPTC7Q8NI37 304 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 LPPQ93052 612 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 VTA1Q9NP79 307 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 POLIQ9UNA4 740 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 LOC285556D6RIA3 1793 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SLC15A5A6NIM6 579 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 F8VZ95 297 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ZSCAN12O43309 604 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 HLA-DRAP01903 254 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SP3Q02447 781 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TEX35Q5T0J7 233 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NAA35Q5VZE5 725 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SAMD3Q8N6K7 520 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 RDM1Q8NG50 284 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CDT1Q9H211 546 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 RAB20Q9NX57 234 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SLC5A4Q9NY91 659 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SNTG2Q9NY99 539 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CEP72Q9P209 647 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 STK24Q9Y6E0 443 aa7.11□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 A0A0B4J269 797 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms