RNA–Protein interactions for RNA: YOR116C

RPO31, Transcript of RNA polymerase III largest subunit C160, yeast

Gene RPO31, Length 4,383 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO31	YOR116C	COQ5	P49017	307 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MUP1	P50276	574 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ADK2	P26364	225 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	EHD3	P28817	500 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YKL187C	P34231	750 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PHO11	P35842	467 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SOL2	P37262	315 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	POP1	P41812	875 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	GDS1	P41913	522 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PET130	P47065	347 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	IBA57	P47158	497 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PUT1	P09368	476 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	GAL3	P13045	520 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	INO4	P13902	151 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SEC22	P22214	214 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YCR007C	P25354	239 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	POF1	P25576	258 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TRS65	P32893	560 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SFK1	P35735	353 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ALY1	P36117	915 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YGR149W	P48236	432 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YGR039W	P53225	103 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	VHT1	P53241	593 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PNG1	Q02890	363 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TMA23	Q03525	211 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YMR160W	Q03823	816 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SLY41	P22215	453 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	DCG1	P32460	244 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MDL1	P33310	695 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ECT1	P33412	323 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ECM14	P38836	430 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	FAA3	P39002	694 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	EOS1	P53938	366 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PHO92	Q06390	306 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	BSP1	Q06604	576 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PLB3	Q08108	686 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	CSM4	Q08955	156 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	STE2	D6VTK4	431 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	AI4	P03878	556 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SHE1	P38200	338 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YBR032W	P38223	100 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	INM1	P38710	295 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PIG2	P40187	538 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SNO3	P43544	222 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	RAD17	P48581	401 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SNO2	P53823	222 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YNL092W	P53934	400 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YPL039W	Q03080	316 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YLR446W	Q06204	433 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SSK1	Q07084	712 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	CRT10	Q08226	957 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SAL1	D6W196	494 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	AAC1	P04710	309 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	BAR1	P12630	587 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	NUP1	P20676	1076 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	LSB5	P25369	354 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	THI4	P32318	326 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	FMT1	P32785	401 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YBR285W	P38354	144 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PHO12	P38693	467 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TOK1	P40310	691 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YLR456W	Q06199	204 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ANT1	Q06497	328 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	JLP1	Q12358	412 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YAR066W	P0CX18	203 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YHR214W	P0CX19	203 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MET22	P32179	357 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.54	□□□□□ -1.84	not detected
RPO31	YOR116C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	DOA1	P36037	715 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PMU1	P36069	295 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	CHS7	P38843	316 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	CDC1	P40986	491 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ALY2	P47029	1046 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ERV29	P53337	310 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	HER2	Q03557	464 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	EKI1	Q03764	534 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SDH7	Q04401	133 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SWC7	Q06707	132 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YLR012C	Q07927	99 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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