RNA–Protein interactions for RNA: YJL059W

YHC3, Transcript of Protein required for the ATP-dependent transport of arginine, yeastyeast

Gene YHC3, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC3YJL059W MMS2P53152 137 aa6□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W NQM1P53228 333 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W STP1Q00947 519 aa6□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W SNX41Q04053 625 aa6□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W YDL218WQ07629 317 aa6□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W YLR053CQ12026 108 aa6□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W ICT1Q12385 394 aa6□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W GCN1P33892 2672 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data5.99□□□□□ -1.45not detected
YHC3YJL059W MTF1P14908 341 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W EXO70P19658 623 aa5.99□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W ISY1P21374 235 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W YCR007CP25354 239 aa5.99□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W HOM6P31116 359 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W YHK8P38776 514 aa5.99□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W BRR6P53062 197 aa5.99□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W ALG13P53178 202 aa5.99□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W MTM1P53320 366 aa5.99□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W SFH1Q06168 426 aa5.99□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W DPM1P14020 267 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W TFS1P14306 219 aa5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W YEF1P32622 495 aa5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W CYC2P38909 366 aa5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W PHO90P39535 881 aa5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W ERV46P39727 415 aa5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W DFG10P40526 253 aa5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W IRC18P47056 224 aa5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W MAL13P53338 473 aa5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W TRM82Q03774 444 aa5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W SWF1Q04629 336 aa5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W GAT3Q07928 141 aa5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W YNG1Q08465 219 aa5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W NSL1Q12143 216 aa5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W YPR064WQ12492 139 aa5.98□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W ECM29P38737 1868 aa5.97□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W HEM15P16622 393 aa5.97□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W KAR9P32526 644 aa5.97□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W YBR241CP38142 488 aa5.97□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W SDS24P38314 527 aa5.97□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W PCL5P38794 229 aa5.97□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W NDT80P38830 627 aa5.97□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W PAC2P39937 518 aa5.97□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W GDS1P41913 522 aa5.97□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W ARO80Q04052 950 aa5.97□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W DIC1Q06143 298 aa5.97□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W RIF2Q06208 395 aa5.97□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W DXO1Q06349 442 aa5.97□□□□□ -1.45
YHC3YJL059W ASP3-2P0CX77 362 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W ASP3-3P0CX78 362 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W ASP3-4P0CX79 362 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W ASP3-1P0CZ17 362 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W CPT1P17898 393 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W HCM1P25364 564 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W RPS2P25443 254 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W TIR2P33890 251 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W CPR5P35176 225 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W YCR087C-AP37263 153 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W YMC2P38087 329 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W APD1P38281 316 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data5.96□□□□□ -1.46not detected
YHC3YJL059W MET30P39014 640 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W EXO1P39875 702 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W YIL169CP40442 995 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W SIM1P40472 476 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W SNX4P47057 423 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W PHO23P50947 330 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W YNR048WP53740 393 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W FYV6P53913 173 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W CDC14Q00684 551 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W ABF2Q02486 183 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W HNT3Q08702 217 aa5.96□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W PET54P10834 293 aa5.95□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W NTF2P33331 125 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W SGE1P33335 543 aa5.95□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W JEN1P36035 616 aa5.95□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W MIT1P40002 666 aa5.95□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W COG3P40094 801 aa5.95□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W YNL320WP42840 284 aa5.95□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W YJR056CP47115 236 aa5.95□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W NRK1P53915 240 aa5.95□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W NUP49Q02199 472 aa5.95□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W YDR248CQ03786 193 aa5.95□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W MFG1Q07684 458 aa5.95□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W YLR012CQ07927 99 aa5.95□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W YOL073CQ08232 322 aa5.95□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W YDR018CQ12185 396 aa5.95□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W YCR100CP25606 316 aa5.94□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W FRE2P36033 711 aa5.94□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W GPX2P38143 162 aa5.94□□□□□ -1.46
YHC3YJL059W ARN1P38731 627 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.8 ms