RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	LMF1	Q96S06	567 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PTPN18	Q99952	460 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	WNT10B	O00744	389 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	ERC2	O15083	957 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PLAT	P00750	562 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	AMY1A	P04745	511 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	ATF3	P18847	181 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	CASR	P41180	1078 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	KAT5	Q92993	513 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	KCNH6	Q9H252	994 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175		H3BML4	177 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	KIF3B	O15066	747 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	AP1G1	O43747	822 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	CDC14B	O60729	498 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	GZMK	P49863	264 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	SP140	Q13342	867 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	MTM1	Q13496	603 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	GBX1	Q14549	363 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175		A0A1W2PRX2	142 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	SLC16A6	O15403	523 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	GPR42	O15529	346 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	RAD17	O75943	681 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	STC2	O76061	302 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	PCSK1	P29120	753 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	IL12RB1	P42701	662 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	FLT3LG	P49771	235 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	NPEPPS	P55786	919 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	TBX4	P57082	545 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	TLE1	Q04724	770 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	GALE	Q14376	348 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	RAB39A	Q14964	217 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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