RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	14.09	□□□□□ -0.15	3e-6	■■■■■ 50.8
BRF1-222	ENST00000635152	TATDN2	Q93075	761 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	PIM2	Q9P1W9	311 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	NFS1	Q9Y697	457 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	PFAS	O15067	1338 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	SPOP	O43791	374 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	SEC24C	P53992	1094 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	FMO1	Q01740	532 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF653	Q96CK0	615 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	FMO2	Q99518	471 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	NUP85	Q9BW27	656 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	TRPC6	Q9Y210	931 aa		14.09	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	MYO1F	O00160	1098 aa		14.08	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	CYP11B1	P15538	503 aa		14.08	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	LSP1	P33241	339 aa		14.08	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	GHRHR	Q02643	423 aa		14.08	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	SLC20A2	Q08357	652 aa		14.08	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		14.08	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		14.08	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	14.08	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		14.08	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		14.08	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		14.08	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		14.08	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	PSME4	Q14997	1843 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	CLSTN1	O94985	981 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	PYGM	P11217	842 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	CCND2	P30279	289 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	C2CD6	Q53TS8	623 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	SV2A	Q7L0J3	742 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	JAML	Q86YT9	394 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	SHC3	Q92529	594 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	NT5C1B	Q96P26	610 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	WRNIP1	Q96S55	665 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	ERP44	Q9BS26	406 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	RAB17	Q9H0T7	212 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	RAB20	Q9NX57	234 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	RGS20	O76081	388 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	PDE6C	P51160	858 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	BACE1	P56817	501 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	14.08	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB7A	O95365	584 aa		14.07	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	14.07	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		14.07	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	KRT71	Q3SY84	523 aa		14.07	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	14.07	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		14.07	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	14.07	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	14.07	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	14.07	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	MTERF2	Q49AM1	385 aa		14.07	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		14.07	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		14.07	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	PRELID2	Q8N945	189 aa		14.07	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		14.07	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	SEC14L1	Q92503	715 aa		14.07	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		14.07	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	MAPK13	O15264	365 aa		14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	TMOD1	P28289	359 aa		14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	KCNJ1	P48048	391 aa		14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	PRKG1	Q13976	671 aa		14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	DUPD1	Q68J44	220 aa		14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM23	A6NLE4	172 aa		14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	PEX10	O60683	326 aa		14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	GZMA	P12544	262 aa		14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	KCNA2	P16389	499 aa		14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	PEX5	P50542	639 aa		14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	CORO7	P57737	925 aa		14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	PRKCE	Q02156	737 aa		14.06	□□□□□ -0.16
BRF1-222	ENST00000635152	CYP24A1	Q07973	514 aa		14.06	□□□□□ -0.16

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