RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 PYGMP11217 842 aa18.81■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 ACTN1P12814 892 aa18.81■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 C3orf67Q6ZVT6 689 aa18.81■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa18.81■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 ERMNQ8TAM6 284 aa18.81■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 OSGEPQ9NPF4 335 aa18.81■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa18.81■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa18.81■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 ATP9BO43861 1147 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 GNAT2P19087 354 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 GALK1P51570 392 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 MTTPP55157 894 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 DNAJC3Q13217 504 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 EXOC3L4Q17RC7 722 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 SETDB2Q96T68 719 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 PHTF1Q9UMS5 762 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 PCDHA4Q9UN74 947 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF711Q9Y462 761 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 MYH3P11055 1940 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 LSM1O15116 133 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 RGL2O15211 777 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 MOGSQ13724 837 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 MYBPC2Q14324 1141 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 MAP7D1Q3KQU3 841 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 SV2BQ7L1I2 683 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 AK8Q96MA6 479 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 GPCPD1Q9NPB8 672 aa18.8■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 EPS15P42566 896 aa18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 NME8Q8N427 588 aa18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 SPOCK2Q92563 424 aa18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 STMN2Q93045 179 aa18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 ANKRD63C9JTQ0 380 aa18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 DDAH1O94760 285 aa18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 ZCWPW2Q504Y3 356 aa18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 CERKQ8TCT0 537 aa18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 TBK1Q9UHD2 729 aa18.79■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 P4HA2O15460 535 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 PHF2O75151 1096 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 HARSP12081 509 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 EMP3P54852 163 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 IL9RQ01113 521 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 AADACL2Q6P093 401 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 NELFCDQ8IXH7 590 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 PROM2Q8N271 834 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 DEPTORQ8TB45 409 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 RIC8AQ9NPQ8 531 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 WASF2Q9Y6W5 498 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 LAD1O00515 517 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 PORP16435 677 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 NPEPPSP55786 919 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 SDR42E1Q8WUS8 393 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 CNNM1Q9NRU3 951 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 ZFP69BQ9UJL9 534 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 STK24Q9Y6E0 443 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 ALDH2P05091 517 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 CA8P35219 290 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 TXKP42681 527 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 GRAMD4Q6IC98 578 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 TTC27Q6P3X3 843 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 TRIM50Q86XT4 487 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 SPATA5Q8NB90 893 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 SYNCQ9H7C4 482 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 CLIC5Q9NZA1 410 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF212Q9UDV6 495 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 BTBD19C9JJ37 291 aa18.77■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 PODXLO00592 558 aa18.77■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 TECP42680 631 aa18.77■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 TRIM59Q8IWR1 403 aa18.77■□□□□ 0.6
GLIS1-202ENST00000628545 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms