RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619785.1

SENP3-210, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-210ENST00000619785 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 B2RBV5 119 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 B4DLN1 442 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 PRDM1O75626 825 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 GH1P01241 217 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 TSPY3P0CV98 308 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 TSPY8P0CW00 308 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 PLCG1P19174 1290 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 CASTP20810 708 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 GYS2P54840 703 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 ZXDAP98168 799 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 COASYQ13057 564 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 ADAM15Q13444 863 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 CAMK1Q14012 370 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 RNF207Q6ZRF8 634 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 KCTD1Q719H9 257 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 ITPRIPQ8IWB1 547 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 SMRP1Q8NCR6 262 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 PPTC7Q8NI37 304 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 AFG1LQ8WV93 481 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 GMIPQ9P107 970 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 CEP250Q9BV73 2442 aa8.46□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.46□□□□□ -1.05
SENP3-210ENST00000619785 LINC01387J3KSC0 135 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ORC4O43929 436 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 MMP1P03956 469 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 MAOBP27338 520 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 NBL1P41271 181 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 TFAP4Q01664 338 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 SIGLEC14Q08ET2 396 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 SQSTM1Q13501 440 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 DGKDQ16760 1214 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 HGSNATQ68CP4 663 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 P2RX5Q93086 422 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 IWS1Q96ST2 819 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 PLVAPQ9BX97 442 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 CLDND1Q9NY35 253 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 TPRP12270 2363 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 M0R2C6 588 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 GFRA2O00451 464 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 HMMRO75330 724 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 PPFIA4O75335 1185 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 BMPR1AP36894 532 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ADAM17P78536 824 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 PPARAQ07869 468 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 INPP5AQ14642 412 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 NCAPHQ15003 741 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 TCEA2Q15560 299 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 SYDE2Q5VT97 1194 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 VHLLQ6RSH7 139 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 SPATC1Q76KD6 591 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 SUSD6Q92537 303 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 APBB2Q92870 758 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 CLEC1BQ9P126 229 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 CD207Q9UJ71 328 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 STXBP3O00186 592 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 GRM6O15303 877 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 RSPH10BP0C881 870 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 PDHBP11177 359 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 AVPR2P30518 371 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 ICAM3P32942 547 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 TDO2P48775 406 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 SNAP25P60880 206 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP3-210ENST00000619785 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.6 ms