RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 EEF1DP3Q658K8 133 aa27.38■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa27.38■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 TMEM169Q96HH4 297 aa27.38■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 ZFP42Q96MM3 310 aa27.38■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 TMEM175Q9BSA9 504 aa27.38■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 GBP3Q9H0R5 595 aa27.38■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 TNFSF13BQ9Y275 285 aa27.38■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 TCHHQ07283 1943 aa27.37■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa27.37■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 AKAP5P24588 427 aa27.37■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 ERVFC1P60507 584 aa27.37■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 HYAL1Q12794 435 aa27.37■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 RRAGBQ5VZM2 374 aa27.37■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 GSTCDQ8NEC7 633 aa27.37■■□□□ 1.97
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PMS1-220ENST00000618056 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
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PMS1-220ENST00000618056 SLC11A1P49279 550 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 SCNN1GP51170 649 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 DSC1Q08554 894 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 GIT2Q14161 759 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 CTC1Q2NKJ3 1217 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 IGSF21Q96ID5 467 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 PTPRHQ9HD43 1115 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 MIOSQ9NXC5 875 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 PARP2Q9UGN5 583 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 H0YCG3 227 aa27.35■■□□□ 1.97
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PMS1-220ENST00000618056 NCKAP1LP55160 1127 aa27.35■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa27.35■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa27.35■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 PARVGQ9HBI0 331 aa27.35■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
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PMS1-220ENST00000618056 KRT18P05783 430 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
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PMS1-220ENST00000618056 COLGALT2Q8IYK4 626 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa27.34■■□□□ 1.97
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PMS1-220ENST00000618056 BRD1O95696 1058 aa27.33■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 GRIK3Q13003 919 aa27.33■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
PMS1-220ENST00000618056 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
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PMS1-220ENST00000618056 FSD2A1L4K1 749 aa27.32■■□□□ 1.96
PMS1-220ENST00000618056 NRP1O14786 923 aa27.32■■□□□ 1.96
PMS1-220ENST00000618056 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
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PMS1-220ENST00000618056 STAT6P42226 847 aa27.32■■□□□ 1.96
PMS1-220ENST00000618056 KCNQ1P51787 676 aa27.32■■□□□ 1.96
PMS1-220ENST00000618056 SV2BQ7L1I2 683 aa27.32■■□□□ 1.96
PMS1-220ENST00000618056 TMC7Q7Z402 723 aa27.32■■□□□ 1.96
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PMS1-220ENST00000618056 EFHBQ8N7U6 833 aa27.32■■□□□ 1.96
PMS1-220ENST00000618056 RPS6KC1Q96S38 1066 aa27.32■■□□□ 1.96
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PMS1-220ENST00000618056 ZNF568Q3ZCX4 644 aa27.31■■□□□ 1.96
PMS1-220ENST00000618056 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
PMS1-220ENST00000618056 PLPP4Q5VZY2 271 aa27.31■■□□□ 1.96
PMS1-220ENST00000618056 ZPBP2Q6X784 338 aa27.31■■□□□ 1.96
PMS1-220ENST00000618056 FIZ1Q96SL8 496 aa27.31■■□□□ 1.96
PMS1-220ENST00000618056 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
PMS1-220ENST00000618056 IGFLR1Q9H665 355 aa27.31■■□□□ 1.96
PMS1-220ENST00000618056 TRAK2O60296 914 aa27.3■■□□□ 1.96
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