RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.65□□□□□ -1.02
ZNF548-208ENST00000597576 CASP10Q92851 521 aa8.65□□□□□ -1.02
ZNF548-208ENST00000597576 LRRC27Q9C0I9 530 aa8.65□□□□□ -1.02
ZNF548-208ENST00000597576 ANKEF1Q9NU02 776 aa8.65□□□□□ -1.02
ZNF548-208ENST00000597576 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ZNF548-208ENST00000597576 HCSTQ9UBK5 93 aa8.65□□□□□ -1.02
ZNF548-208ENST00000597576 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ZNF548-208ENST00000597576 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.65□□□□□ -1.02
ZNF548-208ENST00000597576 RCOR1Q9UKL0 485 aa8.65□□□□□ -1.02
ZNF548-208ENST00000597576 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.65□□□□□ -1.02
ZNF548-208ENST00000597576 USP18Q9UMW8 372 aa8.65□□□□□ -1.02
ZNF548-208ENST00000597576 DNM3Q9UQ16 869 aa8.65□□□□□ -1.02
ZNF548-208ENST00000597576 LZTS1Q9Y250 596 aa8.65□□□□□ -1.02
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.65□□□□□ -1.02
ZNF548-208ENST00000597576 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ACACAQ13085 2346 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 M0QZ92 97 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 TM4SF5O14894 197 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CFHP08603 1231 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 PTMSP20962 102 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 MARK3P27448 753 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 YWHABP31946 246 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 RFC5P40937 340 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 SPIRE1Q08AE8 756 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 PTPAQ15257 358 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 FBXO47Q5MNV8 452 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 PLPP4Q5VZY2 271 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 KANK3Q6NY19 840 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 FAM173BQ6P4H8 233 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CABP7Q86V35 215 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 PJA1Q8NG27 643 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 TCP11Q8WWU5 503 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 MAP7D2Q96T17 732 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 TIPINQ9BVW5 301 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CUEDC2Q9H467 287 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 MAGEF1Q9HAY2 307 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 KCND2Q9NZV8 630 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 STK17AQ9UEE5 414 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 USP25Q9UHP3 1055 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 WASF3Q9UPY6 502 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 EML1O00423 815 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 WNT7AO00755 349 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 LRRN2O75325 713 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 DGAT1O75907 488 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 AMPD3Q01432 767 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 PLCB3Q01970 1234 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CYP4A11Q02928 519 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 PLCB4Q15147 1175 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 NFKBIBQ15653 356 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 GRIK4Q16099 956 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ODR4Q5SWX8 454 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 RRAGBQ5VZM2 374 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ADALQ6DHV7 355 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 TRIM50Q86XT4 487 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 NME8Q8N427 588 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 IQUBQ8NA54 791 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 MCPH1Q8NEM0 835 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 GJA10Q969M2 543 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 DYDC2Q96IM9 177 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CEP170P1Q96L14 293 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 HSD17B14Q9BPX1 270 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 TCF25Q9BQ70 676 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CCSER1Q9C0I3 900 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CSRNP2Q9H175 543 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 IGSF9Q9P2J2 1179 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 TUBE1Q9UJT0 475 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 LHX6Q9UPM6 363 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 COL12A1Q99715 3063 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 APC2O95996 2303 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1W2PQ27 194 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms