RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, human

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTIF-208	ENST00000590422	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	CNNM3	Q8NE01	707 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	RFPL2	O75678	378 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	NPTXR	O95502	500 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	KLK14	Q9P0G3	267 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	STK39	Q9UEW8	545 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	VWA8	A3KMH1	1905 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	DMD	P11532	3685 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	FAM186A	A6NE01	2351 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	GFRA3	O60609	400 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	GLUD1	P00367	558 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	ADH1A	P07327	375 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	DSG1	Q02413	1049 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	BSND	Q8WZ55	320 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422		A0A1B0GUA9	196 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	MED24	O75448	989 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	NPR3	P17342	541 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	MCM7	P33993	719 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	GUCY1B3	Q02153	619 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	CHST7	Q9NS84	486 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	CLUH	O75153	1309 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	TGM5	O43548	720 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	SEC24B	O95487	1268 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	EDN1	P05305	212 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	NEK4	P51957	841 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	GRIK3	Q13003	919 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	TDG	Q13569	410 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	FLCN	Q8NFG4	579 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	MYADM	Q96S97	322 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	PTGES	O14684	152 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	PI15	O43692	258 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	ST18	O60284	1047 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	PAPLN	O95428	1278 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	NUBP1	P53384	320 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	TRIM29	Q14134	588 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	HACE1	Q8IYU2	909 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTIF-208	ENST00000590422	FZD8	Q9H461	694 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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