RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 AMPD3Q01432 767 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 E2F4Q16254 413 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 SFR1Q86XK3 245 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF280BQ86YH2 543 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 THNSL1Q8IYQ7 743 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 HACE1Q8IYU2 909 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 SPPL3Q8TCT6 385 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 URGCPQ8TCY9 931 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC51Q96ER9 411 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 BICD1Q96G01 975 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFP42Q96MM3 310 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 GAD1Q99259 594 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC27Q9C0I9 530 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 CXCL16Q9H2A7 254 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D13Q9NVG8 400 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAJB4Q9UDY4 337 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 GDAQ9Y2T3 454 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa7.47□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 C5orf67F2Z3F1 127 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 H0YCG3 227 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 K7ENM7 598 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 FGF18O76093 207 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC34A2O95436 690 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGB1P05556 798 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 HARSP12081 509 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 PFKFB1P16118 471 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 GAP43P17677 238 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 LAG3P18627 525 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAJB1P25685 340 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 MLH1P40692 756 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 SCNN1GP51170 649 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF131P52739 623 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 BCAR1P56945 870 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 GTF2BQ00403 316 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 SEZ6Q53EL9 994 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF720Q7Z2F6 126 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP57L1Q8IYX8 460 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC43Q8N309 656 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 FSIP1Q8NA03 581 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 POF1BQ8WVV4 589 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 P2RX5Q93086 422 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF558Q96NG5 402 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 PLVAPQ9BX97 442 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 BLZF1Q9H2G9 400 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 TNMDQ9H2S6 317 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 CUEDC2Q9H467 287 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 SPG21Q9NZD8 308 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 LMCD1Q9NZU5 365 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 TBX20Q9UMR3 447 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa7.46□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.45□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.45□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD63C9JTQ0 380 aa7.45□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 NRP1O14786 923 aa7.45□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 CLDN3O15551 220 aa7.45□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 B4GALT3O60512 393 aa7.45□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 GCNT3O95395 438 aa7.45□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 GALTP07902 379 aa7.45□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 SLFN14P0C7P3 912 aa7.45□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 MYBP10242 640 aa7.45□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 SYKP43405 635 aa7.45□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 OR1G1P47890 313 aa7.45□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC11A1P49279 550 aa7.45□□□□□ -1.22
EFTUD2-211ENST00000588374 LIG4P49917 911 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms