RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587465.6

TNNT1-208, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNNT1, Length 1,065 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNT1-208	ENST00000587465	CNNM3	Q8NE01	707 aa		21.5	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		21.5	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	21.5	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	NACC1	Q96RE7	527 aa		21.5	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		21.5	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	21.5	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		21.5	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	FZD8	Q9H461	694 aa		21.5	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	PARP2	Q9UGN5	583 aa		21.5	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	21.5	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	TEX28	O15482	410 aa		21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	CYP11B2	P19099	503 aa		21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	CDC25A	P30304	524 aa		21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	ITIH3	Q06033	890 aa		21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	CABP7	Q86V35	215 aa		21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	PRSS33	Q8NF86	280 aa		21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	HASPIN	Q8TF76	798 aa		21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		21.49	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	PTGES	O14684	152 aa		21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	BRD1	O95696	1058 aa		21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	UROD	P06132	367 aa		21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	SPATA31D3	P0C874	917 aa		21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	PHOX2B	Q99453	314 aa		21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	SNTG2	Q9NY99	539 aa		21.48	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	RFPL2	O75678	378 aa		21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	PRKCB	P05771	671 aa		21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	MTHFR	P42898	656 aa		21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	NHLH1	Q02575	133 aa		21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	PTGDR	Q13258	359 aa		21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	GIT2	Q14161	759 aa		21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	FUT10	Q6P4F1	479 aa		21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	KCNK18	Q7Z418	384 aa		21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	ERMN	Q8TAM6	284 aa		21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		21.47	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	CACNA1H	O95180	2353 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465		E9PMD0	336 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	RECQL4	O94761	1208 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	GLUD2	P49448	558 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	21.46	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	FAM187B	Q17R55	369 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	GPR149	Q86SP6	731 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	ZBTB33	Q86T24	672 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	21.46	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		21.46	■■□□□ 1.03
TNNT1-208	ENST00000587465	MYH11	P35749	1972 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	GRIK3	Q13003	919 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	NAB2	Q15742	525 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	DAW1	Q8N136	415 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	FBXL6	Q8N531	539 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	CHST7	Q9NS84	486 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	GDA	Q9Y2T3	454 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	NR2E1	Q9Y466	385 aa		21.45	■■□□□ 1.02
TNNT1-208	ENST00000587465	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		21.44	■■□□□ 1.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms