RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGMOQ6ZNB7 445 aa36.27■■■■□ 3.4
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CDT1Q9H211 546 aa36.27■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa36.27■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC28A3Q9HAS3 691 aa36.27■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLDN3O15551 220 aa36.26■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCF2P10911 925 aa36.26■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 GATMP50440 423 aa36.26■■■■□ 3.4
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNB1Q14721 858 aa36.26■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLLU1OSQ5K130 101 aa36.26■■■■□ 3.4
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM206Q9H813 350 aa36.26■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 RSAD1Q9HA92 442 aa36.26■■■■□ 3.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC39A2Q9NP94 309 aa36.26■■■■□ 3.4
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF39Q9H2S5 420 aa36.25■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM265A0A087WTH1 108 aa36.24■■■■□ 3.39
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBTB33Q86T24 672 aa36.24■■■■□ 3.39
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR153Q6NV75 609 aa36.24■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC39A4Q6P5W5 647 aa36.24■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYCP3Q8IZU3 236 aa36.24■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 FIBCD1Q8N539 461 aa36.24■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF507Q8TCN5 953 aa36.24■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 APOL6Q9BWW8 343 aa36.24■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 GIT1Q9Y2X7 761 aa36.24■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMC2O95347 1197 aa36.23■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP36.23■■■■□ 3.39
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA20Q8TB22 786 aa36.23■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSDMAQ96QA5 445 aa36.23■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC01553A4QN01 128 aa36.22■■■■□ 3.39
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA0895Q8NCT3 520 aa36.22■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCFD1Q8WVM8 642 aa36.22■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa36.22■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 STYXL1Q9Y6J8 313 aa36.22■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa36.21■■■■□ 3.39
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HAPLN2Q9GZV7 340 aa36.21■■■■□ 3.39
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PARP2Q9UGN5 583 aa36.21■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHD9Q3L8U1 2897 aa36.2■■■■□ 3.39
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CTDNEP1-209ENST00000574205 BMT2Q1RMZ1 405 aa36.2■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC43Q8N309 656 aa36.2■■■■□ 3.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP120Q8N960 986 aa36.2■■■■□ 3.39
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CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0B4J269 797 aa36.19■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOMO2Q5JPE7 1267 aa36.19■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
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CTDNEP1-209ENST00000574205 INPPL1O15357 1258 aa36.18■■■■□ 3.38
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CTDNEP1-209ENST00000574205 THNSL1Q8IYQ7 743 aa36.18■■■■□ 3.38
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF576Q9H609 170 aa36.18■■■■□ 3.38
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GDAQ9Y2T3 454 aa36.18■■■■□ 3.38
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF697Q5TEC3 545 aa36.18■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAD1Q99259 594 aa36.18■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 MSTO1Q9BUK6 570 aa36.18■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 GBP3Q9H0R5 595 aa36.18■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 KANSL3Q9P2N6 904 aa36.18■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KYAT1Q16773 422 aa36.17■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 CITO14578 2027 aa36.16■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa36.16■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 OGTO15294 1046 aa36.16■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADSSP30520 456 aa36.16■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 OSTNP61366 133 aa36.16■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 NELFCDQ8IXH7 590 aa36.16■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 POMGNT1Q8WZA1 660 aa36.16■■■■□ 3.38
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