RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568514.5

SNAP23-218, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 3

Gene SNAP23, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-218	ENST00000568514	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	ABCC5	O15440	1437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	MBD5	Q9P267	1494 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	KDM5C	P41229	1560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	TMEM127	O75204	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	LGALS4	P56470	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	PPARA	Q07869	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	MGAT5	Q09328	741 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	KLF10	Q13118	480 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	UBE3C	Q15386	1083 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	AGL	P35573	1532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	ABCA6	Q8N139	1617 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514		A0A1W2PR48	441 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	RABGGTB	P53611	331 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	DHCR24	Q15392	516 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	RASSF3	Q86WH2	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	USP7	Q93009	1102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-218	ENST00000568514	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	NPAT	Q14207	1427 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	NCOA1	Q15788	1441 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	TACR2	P21452	398 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	ACRV1	P26436	265 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	ACVRL1	P37023	503 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	STAT4	Q14765	748 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	KRT40	Q6A162	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	UIMC1	Q96RL1	719 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	RERE	Q9P2R6	1566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	ROCK1	Q13464	1354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	DAPK3	O43293	454 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	ADCY6	O43306	1168 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	FAM20B	O75063	409 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	PRKD3	O94806	890 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	HK1	P19367	917 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	NR4A1	P22736	598 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	SCAND1	P57086	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	TMPRSS15	P98073	1019 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	CDK17	Q00537	523 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-218	ENST00000568514	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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