RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 SYBUQ9NX95 663 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 B4GALT6Q9UBX8 382 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD3-202ENST00000558300 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 TRIM24O15164 1050 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 PRKD3O94806 890 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 IPO13O94829 963 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 KRT15P19012 456 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 MECP2P51608 486 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 ERVK-21P61565 698 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 TCIRG1Q13488 830 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 ARHGAP44Q17R89 818 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 IQSEC1Q6DN90 963 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 EP400NLQ6ZTU2 488 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 COG1Q8WTW3 980 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 MYEOVQ96EZ4 313 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 GBP4Q96PP9 640 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 FOXB1Q99853 325 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 CABP5Q9NP86 173 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 DENND2AQ9ULE3 1009 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC66A2RUB6 948 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 M0R2C6 588 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 FOXP2O15409 715 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 CREB3O43889 395 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 GAS7O60861 476 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 MFAP3LO75121 409 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 VSIG10L2P0DP72 767 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 SESN3P58005 492 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 IL2P60568 153 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 GTF2H3Q13889 308 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM240Q5SV17 173 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 FSTL4Q6MZW2 842 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 MICALCLQ6ZW33 695 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 RD3Q7Z3Z2 195 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 CLEC14AQ86T13 490 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 C11orf74Q86VG3 221 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 NXPE1Q8N323 547 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 IGSF22Q8N9C0 903 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 ANKS1AQ92625 1134 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 EMC7Q9NPA0 242 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 PRDM11Q9NQV5 511 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 OBP2AQ9NY56 170 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 DKK2Q9UBU2 259 aa4.7□□□□□ -1.66
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TMOD3-202ENST00000558300 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 FZD9O00144 591 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 LDHAP00338 332 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
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TMOD3-202ENST00000558300 RBP3P10745 1247 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 TRIM27P14373 513 aa4.69□□□□□ -1.66
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TMOD3-202ENST00000558300 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 PTPN21Q16825 1174 aa4.69□□□□□ -1.66
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TMOD3-202ENST00000558300 METTL24Q5JXM2 366 aa4.69□□□□□ -1.66
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TMOD3-202ENST00000558300 PPP4R4Q6NUP7 873 aa4.69□□□□□ -1.66
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TMOD3-202ENST00000558300 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa4.68□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 TRIM75PA6NK02 468 aa4.68□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM200CA6NKL6 621 aa4.68□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 KCNK3O14649 394 aa4.68□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
TMOD3-202ENST00000558300 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
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