RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 STX17P56962 302 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 STRN3Q13033 797 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 SPATA1Q5VX52 437 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 LUZP1Q86V48 1076 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 GOLGA5Q8TBA6 731 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 BORCS6Q96GS4 357 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 SCLT1Q96NL6 688 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CDT1Q9H211 546 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 PADI3Q9ULW8 664 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 SIP14410 1827 aa8.56□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 RPS6KA5O75582 802 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ERLIN2O94905 339 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 TIMP1P01033 207 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 MCF2P10911 925 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 NR2F2P24468 414 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 AXLP30530 894 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CASP4P49662 377 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 LIG4P49917 911 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 FPGSQ05932 587 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 SYCP3Q8IZU3 236 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CRIPAKQ8N1N5 446 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 MYLIPQ8WY64 445 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC51Q96ER9 411 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 EEF2KMTQ96G04 330 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 SCLYQ96I15 445 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CPB2Q96IY4 423 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CEP63Q96MT8 703 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CHST12Q9NRB3 414 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 FANCLQ9NW38 375 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 N4BP3O15049 544 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 GPR182O15218 404 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CLIC2O15247 247 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 MAPK13O15264 365 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CALUO43852 315 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ADRB2P07550 413 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ATP1A3P13637 1013 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 RFC2P35250 354 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CCL23P55773 120 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 WNT7BP56706 349 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 PAK2Q13177 524 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 MFSD5Q6N075 450 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 NOTUMQ6P988 496 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CBWD2Q8IUF1 395 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CEP120Q8N960 986 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 RNF214Q8ND24 703 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 PLEKHO2Q8TD55 490 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 SAAL1Q96ER3 474 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 THAP9Q9H5L6 903 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.53□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 C9IYK1 514 aa8.53□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 OGTO15294 1046 aa8.53□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 CLDN3O15551 220 aa8.53□□□□□ -1.04
C16orf62-211ENST00000540101 AP5Z1O43299 807 aa8.53□□□□□ -1.04
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