RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517979.1

CCDC25-202, Transcript of coiled-coil domain containing 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC25, Length 877 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25-202ENST00000517979 GAD1Q99259 594 aa15.15■□□□□ 0.02
CCDC25-202ENST00000517979 KIFC3Q9BVG8 833 aa15.15■□□□□ 0.02
CCDC25-202ENST00000517979 CD320Q9NPF0 282 aa15.15■□□□□ 0.02
CCDC25-202ENST00000517979 A0A1B0GUA9 196 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 VWA3AA6NCI4 1184 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 C2orf71A6NGG8 1288 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 ARL5CA6NH57 179 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 E9PMD0 336 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 DDHD2O94830 711 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 EYA4O95677 639 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 PRKCBP05771 671 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 COASYQ13057 564 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 CUL4AQ13619 759 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 FAM187BQ17R55 369 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 TMEM87AQ8NBN3 555 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 SMRP1Q8NCR6 262 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 TMEM175Q9BSA9 504 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 ZBP1Q9H171 429 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 FZD8Q9H461 694 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 POLD4Q9HCU8 107 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 PRKAG3Q9UGI9 489 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.14■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 N4BP3O15049 544 aa15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 CXCL14O95715 111 aa15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 PDCP20941 246 aa15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 AKAP5P24588 427 aa15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 SCNN1GP51170 649 aa15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 ZP2Q05996 745 aa15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 BRAPQ7Z569 592 aa15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 ADHFE1Q8IWW8 467 aa15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 AUTS2Q8WXX7 1259 aa15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 ZFP42Q96MM3 310 aa15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 RUSC1Q9BVN2 902 aa15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 PDZD7Q9H5P4 517 aa15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 PARP2Q9UGN5 583 aa15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 FAN1Q9Y2M0 1017 aa15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 INPPL1O15357 1258 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 BMP15O95972 392 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 ALDH2P05091 517 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 CTSAP10619 480 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 OR1G1P47890 313 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 EFNA5P52803 228 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 KCNK18Q7Z418 384 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 DRC1Q96MC2 740 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 RPS6KC1Q96S38 1066 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 ADPGKQ9BRR6 497 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 NT5C3AQ9H0P0 336 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 KLK14Q9P0G3 267 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 STK39Q9UEW8 545 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 USP20Q9Y2K6 914 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 CCDC169A6NNP5 214 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 ACKR2O00590 384 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 DPYSL4O14531 572 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 NRP1O14786 923 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 HIP1RO75146 1068 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 NR1I2O75469 434 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 PEX3P56589 373 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 GIT2Q14161 759 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 HYIQ5T013 277 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 RINT1Q6NUQ1 792 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 ANKRD54Q6NXT1 300 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 COLGALT2Q8IYK4 626 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 CASP10Q92851 521 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 PLIN2Q99541 437 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 VN1R3Q9BXE9 311 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 EPHX3Q9H6B9 360 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 MIOSQ9NXC5 875 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 SNPHO15079 494 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 EDN1P05305 212 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 NPTX2P47972 431 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 DSC1Q08554 894 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 GRIK3Q13003 919 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 KCNC3Q14003 757 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 PTPN14Q15678 1187 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 C1orf186Q6ZWK4 172 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 CABP7Q86V35 215 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC25-202ENST00000517979 DAW1Q8N136 415 aa15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms