RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 ALDH2P05091 517 aa15.52■□□□□ 0.08
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PDGFRB-202ENST00000517488 MCM6Q14566 821 aa15.52■□□□□ 0.08
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PDGFRB-202ENST00000517488 COLGALT2Q8IYK4 626 aa15.52■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 VPS52Q8N1B4 723 aa15.52■□□□□ 0.08
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PDGFRB-202ENST00000517488 VN1R2Q8NFZ6 395 aa15.52■□□□□ 0.08
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PDGFRB-202ENST00000517488 OR1G1P47890 313 aa15.5■□□□□ 0.07
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PDGFRB-202ENST00000517488 LLGL2Q6P1M3 1020 aa15.48■□□□□ 0.07
PDGFRB-202ENST00000517488 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PDGFRB-202ENST00000517488 TAS1R1Q7RTX1 841 aa15.48■□□□□ 0.07
PDGFRB-202ENST00000517488 ZBTB33Q86T24 672 aa15.48■□□□□ 0.07
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM178BQ8IXR5 827 aa15.48■□□□□ 0.07
PDGFRB-202ENST00000517488 CEP120Q8N960 986 aa15.48■□□□□ 0.07
PDGFRB-202ENST00000517488 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PDGFRB-202ENST00000517488 CDT1Q9H211 546 aa15.48■□□□□ 0.07
PDGFRB-202ENST00000517488 CD320Q9NPF0 282 aa15.48■□□□□ 0.07
PDGFRB-202ENST00000517488 ODF2LQ9ULJ1 636 aa15.48■□□□□ 0.07
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