RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 RFPL3O75679 317 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 DGKIO75912 1065 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SOD2P04179 222 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 PRR5P85299 388 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SLFN5Q08AF3 891 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 PAK1Q13153 545 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 ATG9AQ7Z3C6 839 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD23Q86SG2 305 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 FAM43AQ8N2R8 423 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 TSPAN17Q96FV3 270 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF112Q9UJU3 913 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 ATRNL1Q5VV63 1379 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 WNT9AO14904 365 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 CRTAMO95727 393 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 CACNB3P54284 484 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 KIF22Q14807 665 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 ATP2B3Q16720 1220 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 OGFOD2Q6N063 350 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 TMC6Q7Z403 805 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 KLHDC4Q8TBB5 520 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 KCNK12Q9HB15 430 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SMC4Q9NTJ3 1288 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 DENND2AQ9ULE3 1009 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 GAKO14976 1311 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 DOCK2Q92608 1830 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 BTBD19C9JJ37 291 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 ENTPD3O75355 529 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 CAPN2P17655 700 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 MTX1Q13505 466 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 BRAPQ7Z569 592 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 JAM3Q9BX67 310 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 IDI2Q9BXS1 227 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 IPPKQ9H8X2 491 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SZT2Q5T011 3432 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 CXCL11O14625 94 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SGSM2O43147 1006 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 PRDX5P30044 214 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 TXKP42681 527 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 CAP1Q01518 475 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SPIRE1Q08AE8 756 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 EMC4Q5J8M3 183 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SDE2Q6IQ49 451 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 C17orf99Q6UX52 265 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 ARHGAP45Q92619 1136 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SCLYQ96I15 445 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 CNTD2Q9H8S5 307 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 LAMA3Q16787 3333 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 KRIT1O00522 736 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 HGSO14964 777 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 MAFKO60675 156 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 HOXD10P28358 340 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 MOGSQ13724 837 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 STEAP3Q658P3 488 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 KCNN1Q92952 543 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 FBXW5Q969U6 566 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 PPP1R16BQ96T49 567 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SLC38A3Q99624 504 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 FEZ1Q99689 392 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 KCNJ15Q99712 375 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SLC6A20Q9NP91 592 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 SRRDQ9UH36 339 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-222ENST00000514552 DOCK1Q14185 1865 aa8.28□□□□□ -1.08
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