RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514305.5

USP53-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 53, humanhuman

TSL 2

Gene USP53, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53-208ENST00000514305 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.16■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.16■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.16■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 OSMRQ99650 979 aa22.16■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.16■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 TMX1Q9H3N1 280 aa22.16■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.16■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.16■■□□□ 1.14
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USP53-208ENST00000514305 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.16■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 MYO7AQ13402 2215 aa22.16■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.15■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.15■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 CSPG5O95196 566 aa22.15■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 IL9P15248 144 aa22.15■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 PTENP60484 403 aa22.15■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 PSMD2Q13200 908 aa22.15■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 CAPSQ13938 189 aa22.15■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.15■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.15■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.15■■□□□ 1.14
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USP53-208ENST00000514305 EXOC1Q9NV70 894 aa22.15■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.15■■□□□ 1.14
USP53-208ENST00000514305 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 SFI1A8K8P3 1242 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 K7ERI5 159 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 ERLIN2O94905 339 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 KIF20AO95235 890 aa22.14■■□□□ 1.13
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USP53-208ENST00000514305 NPTX2P47972 431 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 STRN3Q13033 797 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 MAPK7Q13164 816 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 COL19A1Q14993 1142 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 MAPK6Q16659 721 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 KSR1Q8IVT5 923 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 DAW1Q8N136 415 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 GJD3Q8N144 294 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 ADAM2Q99965 735 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.14■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.13■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.13■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 MGEA5O60502 916 aa22.13■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 AXLP30530 894 aa22.13■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 CUL4BQ13620 913 aa22.13■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.13■■□□□ 1.13
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USP53-208ENST00000514305 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.13■■□□□ 1.13
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USP53-208ENST00000514305 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 HYAL1Q12794 435 aa22.12■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 KCNB1Q14721 858 aa22.12■■□□□ 1.13
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USP53-208ENST00000514305 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.12■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.12■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 HVCN1Q96D96 273 aa22.12■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.12■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.12■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 POLD4Q9HCU8 107 aa22.12■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 AAASQ9NRG9 546 aa22.12■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 K7ENM7 598 aa22.11■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 ITGB1P05556 798 aa22.11■■□□□ 1.13
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USP53-208ENST00000514305 NCKAP1LP55160 1127 aa22.11■■□□□ 1.13
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USP53-208ENST00000514305 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.11■■□□□ 1.13
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USP53-208ENST00000514305 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.1■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 SLC16A4O15374 487 aa22.1■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 FAM187BQ17R55 369 aa22.1■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.1■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.1■■□□□ 1.13
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