RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 CYP24A1Q07973 514 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP44Q17R89 818 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 POTEHQ6S545 545 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM143Q96AN5 459 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 BICD1Q96G01 975 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 FAM167AQ96KS9 214 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 PNKPQ96T60 521 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 LGR5O75473 907 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 H2AFZP0C0S5 128 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 RHOXF2BP0C7M4 288 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 GPC3P51654 580 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 STRN3Q13033 797 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CRHR2Q13324 411 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 H2AFVQ71UI9 128 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CAGE1Q8TC20 777 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 COG1Q8WTW3 980 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 GPR20Q99678 358 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 RHOXF2Q9BQY4 288 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1586Q9HCI6 787 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 RNF186Q9NXI6 227 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CENPFP49454 3210 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CA12O43570 354 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 NCK2O43639 380 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 EXTL3O43909 919 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D8O95759 1140 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 LIG4P49917 911 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 DEPTORQ8TB45 409 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 AZI2Q9H6S1 392 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 LRRIQ4A6NIV6 560 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF233A6NK53 670 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CLDN10P78369 228 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 WDR93Q6P2C0 686 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 SEMA4DQ92854 862 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 FAM213AQ9BRX8 229 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 WBP1LQ9NX94 342 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 RNF14Q9UBS8 474 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 NCANO14594 1321 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 MGAMO43451 1857 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ANK1P16157 1881 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ASB14A6NK59 587 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 K7ERI5 159 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 NOP56O00567 594 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 FTCDO95954 541 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM253P0C7T8 217 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 TNFAIP3P21580 790 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 GALCP54803 685 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 MFAP3P55082 362 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 VSNL1P62760 191 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CAPSQ13938 189 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 WDR78Q5VTH9 848 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 SV2AQ7L0J3 742 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 DNAAF5Q86Y56 855 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC57Q8N9N7 239 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 SHC3Q92529 594 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 AGPAT1Q99943 283 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 EFCC1Q9HA90 598 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 RAB20Q9NX57 234 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ADCY3O60266 1144 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ERLIN1O75477 346 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 LDHAP00338 332 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 DLATP10515 647 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CXCR5P32302 372 aa8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms