RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498326.5

CLDN12-215, Transcript of claudin 12, human

TSL 5

Gene CLDN12, Length 342 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLDN12-215	ENST00000498326	CCDC69	A6NI79	296 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	SGSM2	O43147	1006 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	DCX	O43602	365 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	MMP1	P03956	469 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	CYP21A2	P08686	494 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	ADM	P35318	185 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	PPM1A	P35813	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	BMPR1A	P36894	532 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	SNAP25	P60880	206 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	KCNA1	Q09470	495 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	GIT2	Q14161	759 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	FLCN	Q8NFG4	579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	GLG1	Q92896	1179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	INCENP	Q9NQS7	918 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	ESYT2	A0FGR8	921 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	FAM170B	A6NMN3	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326		E7EWF7	191 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	MEIS2	O14770	477 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	GPR182	O15218	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	MAGEB2	O15479	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	CYP26A1	O43174	497 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	HBP1	O60381	514 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	DGKI	O75912	1065 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	EYA4	O95677	639 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	DLGAP3	O95886	979 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	C1R	P00736	705 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	ZNF286B	P0CG31	522 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	MYOG	P15173	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	KCNA5	P22460	613 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	CHML	P26374	656 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	TMOD1	P28289	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	GNA11	P29992	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	USP11	P51784	963 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	DEFB103A	P81534	67 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	ARHGAP4	P98171	946 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	TFF2	Q03403	129 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	COASY	Q13057	564 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	GPM6B	Q13491	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	GPNMB	Q14956	572 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	ZNF124	Q15973	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	CBLL1	Q75N03	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLDN12-215	ENST00000498326	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms