RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 GORASP1Q9BQQ3 440 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 VPS16Q9H269 839 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 KIF17Q9P2E2 1029 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TMCO1Q9UM00 188 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TJP1Q07157 1748 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM221AA4D161 298 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC35F4A4IF30 521 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TSPAN3O60637 253 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.95e-37■■■□□ 17.9
RABGGTB-214ENST00000497648 NPPAP01160 153 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 OPN1MWP04001 364 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 PCNAP12004 261 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 RHOQP17081 205 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 GPTP24298 496 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CETN2P41208 172 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 BAG6P46379 1132 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 GTF2A2P52657 109 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 PPP2R3AQ06190 1150 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 POU4F2Q12837 409 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TLR1Q15399 786 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 C1orf141Q5JVX7 400 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 POMZP3Q6PJE2 187 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 LPCAT2Q7L5N7 544 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC50Q8IVM0 306 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 NKAIN4Q8IVV8 208 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 PALM2Q8IXS6 379 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 OR6C4Q8NGE1 309 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TRPM4Q8TD43 1214 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 PIGBQ92521 554 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 SPATA17Q96L03 361 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TRPV4Q9HBA0 871 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC39A1Q9NY26 324 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 EXTL2Q9UBQ6 330 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 CLEC4AQ9UMR7 237 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 MED16Q9Y2X0 877 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TIMM22Q9Y584 194 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 USP3Q9Y6I4 520 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ESYT3A0FGR9 886 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM196BA6NMK8 535 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 USP17L15C9J2P7 530 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 USP17L10C9JJH3 530 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 USP17L12C9JPN9 530 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 USP17L11C9JVI0 530 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 USP17L21D6R901 530 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 USP17L18D6R9N7 530 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 USP17L22D6RA61 530 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 USP17L19D6RCP7 530 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 USP17L20D6RJB6 530 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 PSMD9O00233 223 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 MAPK13O15264 365 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 STRNO43815 780 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 UBL4AP11441 157 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 KRT4P19013 534 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ACADSBP45954 432 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 RARSP54136 660 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 PMS1P54277 932 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 EPHA4P54764 986 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 USP17L24Q0WX57 530 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 MTX1Q13505 466 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 SNX1Q13596 522 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 STK38Q15208 465 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 INSCQ1MX18 579 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ODF2Q5BJF6 829 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 WLSQ5T9L3 541 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM53Q6P2H8 277 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM26EQ8N5C1 309 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-214ENST00000497648 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms