RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 C4orf19Q8IY42 314 aa25.73■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 GPR65Q8IYL9 337 aa25.73■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 RNF149Q8NC42 400 aa25.73■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 GAD1Q99259 594 aa25.73■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa25.73■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 TBC1D17Q9HA65 648 aa25.73■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 PATJQ8NI35 1801 aa25.72■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 STK25O00506 426 aa25.72■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 ERLIN2O94905 339 aa25.72■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 LARGE1O95461 756 aa25.72■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 AXLP30530 894 aa25.72■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 EMC2Q15006 297 aa25.72■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa25.72■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 WASF1Q92558 559 aa25.72■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 RNF39Q9H2S5 420 aa25.72■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa25.72■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 CA14Q9ULX7 337 aa25.72■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 TSPAN1O60635 241 aa25.71■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 YWHABP31946 246 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 MLH1P40692 756 aa25.71■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.71■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 NOTUMQ6P988 496 aa25.71■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 TMX3Q96JJ7 454 aa25.71■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 LXNQ9BS40 222 aa25.71■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 NT5C3AQ9H0P0 336 aa25.71■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 MIOSQ9NXC5 875 aa25.71■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa25.71■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 NCOR2Q9Y618 2525 aa25.7■■□□□ 1.71
SIMC1-208ENST00000495423 ANHXE9PGG2 379 aa25.7■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 F8W810 466 aa25.7■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 LAMP2P13473 410 aa25.7■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 RFX1P22670 979 aa25.7■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 SCNN1GP51170 649 aa25.7■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 PTENP60484 403 aa25.7■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 EPHA7Q15375 998 aa25.7■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 OTUD6AQ7L8S5 288 aa25.7■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 GPR152Q8TDT2 470 aa25.7■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 ZFP42Q96MM3 310 aa25.7■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 FNIP2Q9P278 1114 aa25.7■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 TBX3O15119 743 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 TGM5O43548 720 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 NR1I2O75469 434 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 SPATA31D3P0C874 917 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 MYBP10242 640 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 HTR4Q13639 388 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 LILRA6Q6PI73 481 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 NECAB1Q8N987 351 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 KCNG4Q8TDN1 519 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 AIFM3Q96NN9 605 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 COLEC11Q9BWP8 271 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 PRKD2Q9BZL6 878 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 CSRNP2Q9H175 543 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 PIDD1Q9HB75 910 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 ARHGEF3Q9NR81 526 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 GIT1Q9Y2X7 761 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 HES2Q9Y543 173 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 R4GN57 208 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 VWA8A3KMH1 1905 aa25.69■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 GPR179Q6PRD1 2367 aa25.68■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 CTDNEP1O95476 244 aa25.68■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 POU5F1BQ06416 359 aa25.68■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 POTEGQ6S5H5 508 aa25.68■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 NEK8Q86SG6 692 aa25.68■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 PALB2Q86YC2 1186 aa25.68■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 HAS1Q92839 578 aa25.68■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 MTRQ99707 1265 aa25.68■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 NOTCH4Q99466 2003 aa25.68■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.68■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 XBP1P17861 261 aa25.67■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 CREMQ03060 361 aa25.67■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 USP41Q3LFD5 358 aa25.67■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 XKR9Q5GH70 373 aa25.67■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 FUT10Q6P4F1 479 aa25.67■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 GSTCDQ8NEC7 633 aa25.67■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 CPB2Q96IY4 423 aa25.67■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 GPR62Q9BZJ7 368 aa25.67■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.67■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.67■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 RGL1Q9NZL6 768 aa25.67■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 SIT1Q9Y3P8 196 aa25.67■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.66■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 SPIRE1Q08AE8 756 aa25.66■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 ST3GAL1Q11201 340 aa25.66■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 AMHR2Q16671 573 aa25.66■■□□□ 1.7
SIMC1-208ENST00000495423 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
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