RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 RTN1Q16799 776 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 XKR3Q5GH77 459 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 GAD1Q99259 594 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CHRDQ9H2X0 955 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 BRD9Q9H8M2 597 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CHST7Q9NS84 486 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ARL5CA6NH57 179 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 GDF9O60383 454 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 TADA2AO75478 443 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ECI2O75521 394 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 GNA11P29992 359 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CNR2P34972 360 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CXCL12P48061 93 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 NUCB1Q02818 461 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 DSC1Q08554 894 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 NOTUMQ6P988 496 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PDXDC1Q6P996 788 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 LILRA6Q6PI73 481 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CEP57Q86XR8 500 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 KSR1Q8IVT5 923 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SMC5Q8IY18 1101 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 RDM1Q8NG50 284 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ITFG1Q8TB96 612 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ING5Q8WYH8 240 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 DNASE1L2Q92874 299 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 B3GALT6Q96L58 329 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 MBOAT7Q96N66 472 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 RIT2Q99578 217 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 APOL6Q9BWW8 343 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 C6orf50Q9HD87 102 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 GDE1Q9NZC3 331 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 IPPQ9Y573 584 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 FRYQ5TBA9 3013 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 TMEM150BA6NC51 233 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 F8W810 466 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ZBTB43O43298 467 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 TDGF1P13385 188 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 AXLP30530 894 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CIITAP33076 1130 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 LIMK1P53667 647 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 GRIK3Q13003 919 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 AAMPQ13685 434 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PSMD5Q16401 504 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 APOA5Q6Q788 366 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 RNF149Q8NC42 400 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 EXOC6Q8TAG9 804 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 BICD2Q8TD16 824 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 FAM3CQ92520 227 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 IRF7Q92985 503 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CCDC51Q96ER9 411 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ZFP42Q96MM3 310 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 TTPALQ9BTX7 342 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms