RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486199.5

PHF20L1-215, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, humanhuman

TSL 2

Gene PHF20L1, Length 1,633 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20L1-215ENST00000486199 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.65□□□□□ -1.34
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PHF20L1-215ENST00000486199 IQCDQ96DY2 449 aa6.65□□□□□ -1.34
PHF20L1-215ENST00000486199 FBXL18Q96ME1 805 aa6.65□□□□□ -1.34
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PHF20L1-215ENST00000486199 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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PHF20L1-215ENST00000486199 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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PHF20L1-215ENST00000486199 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF20L1-215ENST00000486199 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF20L1-215ENST00000486199 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF20L1-215ENST00000486199 TTC37Q6PGP7 1564 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF20L1-215ENST00000486199 PASKQ96RG2 1323 aa6.64□□□□□ -1.35
PHF20L1-215ENST00000486199 PTPRTO14522 1441 aa6.63□□□□□ -1.35
PHF20L1-215ENST00000486199 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PHF20L1-215ENST00000486199 H7C1W4 665 aa6.63□□□□□ -1.35
PHF20L1-215ENST00000486199 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PHF20L1-215ENST00000486199 PODXLO00592 558 aa6.63□□□□□ -1.35
PHF20L1-215ENST00000486199 SIGLEC6O43699 453 aa6.63□□□□□ -1.35
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