RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482158.1

SF3B1-210, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene SF3B1, Length 772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1-210ENST00000482158 GPR135Q8IZ08 494 aa7.39□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.39□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 LGI4Q8N135 537 aa7.39□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.39□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 REPS2Q8NFH8 660 aa7.39□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.39□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 FEZF2Q8TBJ5 459 aa7.39□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 RAB24Q969Q5 203 aa7.39□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.39□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 PTPN18Q99952 460 aa7.39□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.39□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 ERC2O15083 957 aa7.38□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 PRC1O43663 620 aa7.38□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 GASTP01350 101 aa7.38□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 ALDH2P05091 517 aa7.38□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 MYBP10242 640 aa7.38□□□□□ -1.23
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SF3B1-210ENST00000482158 GUCY1A2P33402 732 aa7.38□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 EPHB4P54760 987 aa7.38□□□□□ -1.23
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SF3B1-210ENST00000482158 DUSP8Q13202 625 aa7.38□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 DGKHQ86XP1 1220 aa7.38□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.38□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 TIFAQ96CG3 184 aa7.38□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 DPYSL5Q9BPU6 564 aa7.38□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 LDAHQ9H6V9 325 aa7.38□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 SGTAO43765 313 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 DTNBO60941 627 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 BMP7P18075 431 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 RAC3P60763 192 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 ATP8B2P98198 1209 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 CDC42EP1Q00587 391 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 RIN1Q13671 783 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 KRT40Q6A162 431 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 XYLT2Q9H1B5 865 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.37□□□□□ -1.23
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SF3B1-210ENST00000482158 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.37□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 ZMYM3Q14202 1370 aa7.36□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 H3BML4 177 aa7.36□□□□□ -1.23
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SF3B1-210ENST00000482158 PCSK1P29120 753 aa7.36□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 PLEKHH3Q7Z736 793 aa7.36□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 SHCBP1Q8NEM2 672 aa7.36□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 MDM1Q8TC05 714 aa7.36□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 IFI44Q8TCB0 444 aa7.36□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.36□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 STON2Q8WXE9 905 aa7.36□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 CEP95Q96GE4 821 aa7.36□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.36□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.36□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 USP40Q9NVE5 1235 aa7.36□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.36□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 UBE2QL1A1L167 161 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 NRP1O14786 923 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 TUSC2O75896 110 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 STC2O76061 302 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 UBXN7O94888 489 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 SYN1P17600 705 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 CR2P20023 1033 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 MAP2K6P52564 334 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 USP14P54578 494 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 PER3P56645 1201 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 MTM1Q13496 603 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 MFSD14BQ5SR56 506 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 TTC7BQ86TV6 843 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 SIAH1Q8IUQ4 282 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 DENND1CQ8IV53 801 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 DRC7Q8IY82 874 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 OR5M3Q8NGP4 307 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 SAMD11Q96NU1 681 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 LMF1Q96S06 567 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 CGRRF1Q99675 332 aa7.35□□□□□ -1.23
SF3B1-210ENST00000482158 KCNH6Q9H252 994 aa7.35□□□□□ -1.23
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