RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 PLCB3Q01970 1234 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 SV2BQ7L1I2 683 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 MYCT1Q8N699 235 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 PANK2Q9BZ23 570 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 TLR9Q9NR96 1032 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 K7ENM7 598 aa22.85■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 SCNN1GP51170 649 aa22.85■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 KRT17Q04695 432 aa22.85■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.85■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.85■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.85■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 LZTS1Q9Y250 596 aa22.85■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.85■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 KRT85P78386 507 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 SHC4Q6S5L8 630 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 DYMQ7RTS9 669 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 TMEM169Q96HH4 297 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 SNTG2Q9NY99 539 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 KLK14Q9P0G3 267 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 COG5Q9UP83 839 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 VCANP13611 3396 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 TRAK2O60296 914 aa22.83■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 B4GALT3O60512 393 aa22.83■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 RECQL4O94761 1208 aa22.83■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 DDHD2O94830 711 aa22.83■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 IRS1P35568 1242 aa22.83■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.83■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.83■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 DDX12PQ92771 950 aa22.83■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 HLA-CQ95604 372 aa22.83■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.83■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.83■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 GALTP07902 379 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 SCP2P22307 547 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 SLC11A1P49279 550 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 CDT1Q9H211 546 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 GDAQ9Y2T3 454 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 MYMKA6NI61 221 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 GRIK3Q13003 919 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 BICD1Q96G01 975 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 SPATA32Q96LK8 384 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 TCF25Q9BQ70 676 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 TCHPQ9BT92 498 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 CUEDC2Q9H467 287 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 PROZP22891 400 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 ABCD1P33897 745 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 ERVFC1P60507 584 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 E2F4Q16254 413 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 ZPBP2Q6X784 338 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB33Q86T24 672 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 KCNN1Q92952 543 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 DHX58Q96C10 678 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 IGSF21Q96ID5 467 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 MIOSQ9NXC5 875 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 TOM1L1O75674 476 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 MCF2P10911 925 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 TFF2Q03403 129 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 DSC1Q08554 894 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 RESP18Q5W5W9 173 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 SFR1Q86XK3 245 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 CEP120Q8N960 986 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 TNMDQ9H2S6 317 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 NR1I2O75469 434 aa22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 ALDH2P05091 517 aa22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 GRM5P41594 1212 aa22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms