RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480022.1

CHD6-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 6, human

TSL 2

Gene CHD6, Length 2,829 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD6-208	ENST00000480022	LSAMP	Q13449	338 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	DAAM2	Q86T65	1068 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	FAM151A	Q8WW52	585 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	HAPLN3	Q96S86	360 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022		A0A087X0T9	212 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	ENTPD5	O75356	428 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	FAM228B	P0C875	321 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	CYP2D6	P10635	497 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	TNNI2	P48788	182 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	STK4	Q13043	487 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	INTU	Q9ULD6	942 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	ABCB11	O95342	1321 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	SMIM22	K7EJ46	135 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	KCNMA1	Q12791	1236 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	MPP3	Q13368	585 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	DUPD1	Q68J44	220 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	LDHD	Q86WU2	507 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	HIC2	Q96JB3	615 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	CEP72	Q9P209	647 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	HAO1	Q9UJM8	370 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	TMEM120B	A0PK00	339 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	ADM5	C9JUS6	153 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	KLRC3	Q07444	240 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	PPP2R5B	Q15173	497 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	NPY5R	Q15761	445 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	GSTA3	Q16772	222 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	PTPRO	Q16827	1216 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	DLK2	Q6UY11	383 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	STKLD1	Q8NE28	680 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	ERP44	Q9BS26	406 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	MIS12	Q9H081	205 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	CUEDC2	Q9H467	287 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	EYA4	O95677	639 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	GNA14	O95837	355 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	EPHB2	P29323	1055 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	RASSF2	P50749	326 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	PLTP	P55058	493 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	SBK1	Q52WX2	424 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	C12orf60	Q5U649	245 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	WDR78	Q5VTH9	848 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	GALNT17	Q6IS24	598 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	MFSD5	Q6N075	450 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	CGB2	Q6NT52	195 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	SULF1	Q8IWU6	871 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	ERP27	Q96DN0	273 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	TEPSIN	Q96N21	525 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	PLIN2	Q99541	437 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	RPTOR	Q8N122	1335 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHD6-208	ENST00000480022	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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