RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 RUNDC1Q96C34 613 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 GPHA2Q96T91 129 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 LANCL2Q9NS86 450 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-208ENST00000472760 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.21□□□□□ -1.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 PTPN7P35236 360 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 GNALP38405 381 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC6A9P48067 706 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 NPEPPSP55786 919 aa6.21□□□□□ -1.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 DGKHQ86XP1 1220 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 CFHR4Q92496 578 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.21□□□□□ -1.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.21□□□□□ -1.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 LDAHQ9H6V9 325 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.21□□□□□ -1.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 A0A1W2PRX2 142 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 UBE2QL1A1L167 161 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 ADCY6O43306 1168 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 CDC14BO60729 498 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 CR2P20023 1033 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 ADAM8P78325 824 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 RIN1Q13671 783 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 CCDC157Q569K6 752 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 DENND1CQ8IV53 801 aa6.2□□□□□ -1.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 REPS2Q8NFH8 660 aa6.2□□□□□ -1.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 MDM1Q8TC05 714 aa6.2□□□□□ -1.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 TMX3Q96JJ7 454 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 TMEM140Q9NV12 185 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 H3BML4 177 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 MATN2O00339 956 aa6.19□□□□□ -1.42
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PRPF40A-208ENST00000472760 CNR2P34972 360 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 APBA1Q02410 837 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 DSC2Q02487 901 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 GBX1Q14549 363 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 GRM3Q14832 879 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 STON2Q8WXE9 905 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 RGMAQ96B86 450 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 TCF25Q9BQ70 676 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 MSL2Q9HCI7 577 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 POLHQ9Y253 713 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF536O15090 1300 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC16A6O15403 523 aa6.18□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 ALDH2P05091 517 aa6.18□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 IL2RBP14784 551 aa6.18□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 GZMKP49863 264 aa6.18□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 EPHB4P54760 987 aa6.18□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 RAB39AQ14964 217 aa6.18□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 SLFN13Q68D06 897 aa6.18□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.18□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.18□□□□□ -1.42
PRPF40A-208ENST00000472760 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.18□□□□□ -1.42
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