RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 BMP1P13497 986 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 DARSP14868 501 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 CSF2RAP15509 400 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 GAP43P17677 238 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 CD52P31358 61 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 PHKA2P46019 1235 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 PTENP60484 403 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 CDC42EP1Q00587 391 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 LPIN1Q14693 890 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP2R5AQ15172 486 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 NFKBIBQ15653 356 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXO47Q5MNV8 452 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 MFSD5Q6N075 450 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF410Q86VK4 478 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM199Q8N511 208 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 ITPKCQ96DU7 683 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC34Q96HJ3 373 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 FIZ1Q96SL8 496 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 IFT122Q9HBG6 1241 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 KMT5AQ9NQR1 393 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 USP20Q9Y2K6 914 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 NR2E3Q9Y5X4 410 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 K7ENM7 598 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 RPS6KA5O75582 802 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 MBD3O95983 291 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 MYL1P05976 194 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 MYBP10242 640 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 ACRP10323 421 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 CASP5P51878 434 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 SMTNP53814 917 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 NCKAP1LP55160 1127 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 POU5F1BQ06416 359 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 TCTN1Q2MV58 587 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 ISM2Q6H9L7 571 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 HAUS6Q7Z4H7 955 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM228AQ86W67 206 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM178BQ8IXR5 827 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 SMARCE1Q969G3 411 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 VWCEQ96DN2 955 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 C17orf75Q9HAS0 396 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 EXOC1Q9NV70 894 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 DENND3A2RUS2 1198 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 H0YGN5 161 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 K7ERI5 159 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 BIN1O00499 593 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 B4GALT5O43286 388 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 SMC2O95347 1197 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 GCNT3O95395 438 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 CXCL10P02778 98 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 EDN1P05305 212 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 PRKCBP05771 671 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 PTMSP20962 102 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 RFC2P35250 354 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 FPGSQ05932 587 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 EHHADHQ08426 723 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 STK4Q13043 487 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 PAK2Q13177 524 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 CPB2Q96IY4 423 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 IKZF4Q9H2S9 585 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD28-208ENST00000463533 FZD8Q9H461 694 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms