RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 TDP1Q9NUW8 608 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-205ENST00000462042 POLHQ9Y253 713 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-205ENST00000462042 ITGA10O75578 1167 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ARIH2O95376 493 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 NPEPPSP55786 919 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 RAB39AQ14964 217 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 DENND1CQ8IV53 801 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM140Q9NV12 185 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 TEX33O43247 280 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 IL2RBP14784 551 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 SREBF1P36956 1147 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 EPHB4P54760 987 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ADAM8P78325 824 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 IL10RAQ13651 578 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 RSPH3Q86UC2 560 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 C1QL4Q86Z23 238 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 SHCBP1Q8NEM2 672 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 OR5M3Q8NGP4 307 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 CFHR4Q92496 578 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 TTC17Q96AE7 1141 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 IL23AQ9NPF7 189 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 LAMTOR5O43504 91 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM13O60858 407 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 CR2P20023 1033 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 GZMKP49863 264 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 DSC2Q02487 901 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 SP140Q13342 867 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 RIN1Q13671 783 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 RGMAQ96B86 450 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM167AQ96KS9 214 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 LMF1Q96S06 567 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 GPHA2Q96T91 129 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 NCDNQ9UBB6 729 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A1W2PRX2 142 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ADCY6O43306 1168 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 MYL1P05976 194 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 GUCY1A2P33402 732 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 PTPN7P35236 360 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC6A9P48067 706 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 APBA1Q02410 837 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP2B3Q16720 1220 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 SLFN13Q68D06 897 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 C3orf20Q8ND61 904 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 KAT5Q92993 513 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 IL17RAQ96F46 866 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 TCF25Q9BQ70 676 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ADAMTS20P59510 1910 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 MATN2O00339 956 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 PLIN1O60240 522 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR32O75388 356 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 CASRP41180 1078 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 FLT3LGP49771 235 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 PTH1RQ03431 593 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM47AQ5JRC9 791 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 GADL1Q6ZQY3 521 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ARL8AQ96BM9 186 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 BORCS6Q96GS4 357 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM60Q9H2L4 133 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms