RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 GAP43P17677 238 aa23.51■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 ABCD1P33897 745 aa23.51■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 PPM1AP35813 382 aa23.51■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 MLH1P40692 756 aa23.51■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 E2F4Q16254 413 aa23.51■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 STAMQ92783 540 aa23.51■■□□□ 1.35
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ABCD4-202ENST00000460308 FGF18O76093 207 aa23.5■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 CMA1P23946 247 aa23.5■■□□□ 1.35
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ABCD4-202ENST00000460308 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.5■■□□□ 1.35
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ABCD4-202ENST00000460308 RPS6KC1Q96S38 1066 aa23.5■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.5■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.5■■□□□ 1.35
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ABCD4-202ENST00000460308 SPG21Q9NZD8 308 aa23.5■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 KLK14Q9P0G3 267 aa23.5■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 SEL1LQ9UBV2 794 aa23.5■■□□□ 1.35
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ABCD4-202ENST00000460308 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.352e-10■■□□□ 11.7
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ABCD4-202ENST00000460308 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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ABCD4-202ENST00000460308 SFR1Q86XK3 245 aa23.49■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23.49■■□□□ 1.35
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ABCD4-202ENST00000460308 ZFP42Q96MM3 310 aa23.49■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 PANK4Q9NVE7 773 aa23.49■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.49■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 TBX20Q9UMR3 447 aa23.49■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 GDAQ9Y2T3 454 aa23.49■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 TOM1L1O75674 476 aa23.48■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 CSPG5O95196 566 aa23.48■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 PBX3P40426 434 aa23.48■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 SCNN1GP51170 649 aa23.48■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 UBE3AQ05086 875 aa23.48■■□□□ 1.35
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ABCD4-202ENST00000460308 MPZL3Q6UWV2 235 aa23.48■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF280BQ86YH2 543 aa23.48■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.48■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.48■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 PTPRHQ9HD43 1115 aa23.48■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa23.48■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 A0A1B0GVL5 298 aa23.47■■□□□ 1.35
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ABCD4-202ENST00000460308 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
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ABCD4-202ENST00000460308 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.47■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa23.47■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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ABCD4-202ENST00000460308 NR1I2O75469 434 aa23.46■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 DDHD2O94830 711 aa23.46■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 GALTP07902 379 aa23.46■■□□□ 1.35
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ABCD4-202ENST00000460308 ZNF720Q7Z2F6 126 aa23.46■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.46■■□□□ 1.35
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ABCD4-202ENST00000460308 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 FIZ1Q96SL8 496 aa23.46■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.46■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 TRIM9Q9C026 710 aa23.46■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.46■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 MIOSQ9NXC5 875 aa23.46■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.46■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.46■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
ABCD4-202ENST00000460308 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.45■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 PROZP22891 400 aa23.45■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 GRM5P41594 1212 aa23.45■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 OSTNP61366 133 aa23.45■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 ASIC1P78348 528 aa23.45■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 PPP2R3CQ969Q6 453 aa23.45■■□□□ 1.34
ABCD4-202ENST00000460308 TLR9Q9NR96 1032 aa23.45■■□□□ 1.34
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