RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 CALUO43852 315 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 ERLIN2O94905 339 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 FGBP02675 491 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 ADRB2P07550 413 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 MCF2P10911 925 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 FGFR4P22455 802 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 CD52P31358 61 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 KCNJ6P48051 423 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 IKBKEQ14164 716 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 SPATA1Q5VX52 437 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 KLHL10Q6JEL2 608 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 NOTUMQ6P988 496 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 CATSPER4Q7RTX7 472 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC01599Q8WXQ3 324 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 CEP63Q96MT8 703 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 FTHL17Q9BXU8 183 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 PADI3Q9ULW8 664 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 USP20Q9Y2K6 914 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 CEP290O15078 2479 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 N4BP3O15049 544 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 MGEA5O60502 916 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 AKAP3O75969 853 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 BAIAP3O94812 1187 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 ACRP10323 421 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 NR2F2P24468 414 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 LIG4P49917 911 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 STX17P56962 302 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM132AQ24JP5 1023 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 TCTN1Q2MV58 587 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 SLFN12LQ6IEE8 588 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC27A1Q6PCB7 646 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 CRIPAKQ8N1N5 446 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 TSG101Q99816 390 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 THAP9Q9H5L6 903 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 HSPBP1Q9NZL4 362 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 COL4A6Q14031 1691 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 OGTO15294 1046 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 INPPL1O15357 1258 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 CLDN3O15551 220 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 EXTL3O43909 919 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF623O75123 536 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL13P26373 211 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 BMP8BP34820 402 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 GRM5P41594 1212 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 CLDN10P78369 228 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM189BP81408 668 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 KYAT1Q16773 422 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF568Q3ZCX4 644 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 ARMCX5Q6P1M9 558 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 CHRDL2Q6WN34 429 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF365Q70YC5 407 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 LUZP1Q86V48 1076 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 SYCP3Q8IZU3 236 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 AOPEPQ8N6M6 819 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 XXYLT1Q8NBI6 393 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 DBF4BQ8NFT6 615 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 CPB2Q96IY4 423 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 RBSNQ9H1K0 784 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 RGS18Q9NS28 235 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 MICAL3Q7RTP6 2002 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A0U1RQF3 1178 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1W2PPC1 479 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 LRRC10BA6NIK2 292 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 C9IYK1 514 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 CETN3O15182 167 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 AMHP03971 560 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 CASP4P49662 377 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP4-207ENST00000454947 RAB27AP51159 221 aa10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms