RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438490.2

RALGAPB-204, Transcript of Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit, human

TSL 5

Gene RALGAPB, Length 4,075 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RALGAPB-204	ENST00000438490	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	RARRES1	P49788	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	VAMP7	P51809	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZIM3	Q96PE6	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490		H0YCG3	227 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490		K7ENM7	598 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	RTN2	O75298	545 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62	6e-8	■■■■□ 22.3
RALGAPB-204	ENST00000438490	IRAK1	P51617	712 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	OAZ1	P54368	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PSMC5	P62195	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	BIRC3	Q13489	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	TNFAIP1	Q13829	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SRL	Q86TD4	932 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	GPRASP2	Q96D09	838 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	GGT7	Q9UJ14	662 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	COL4A5	P29400	1685 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	NFASC	O94856	1347 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CLRN2	A0PK11	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SFI1	A8K8P3	1242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SMAP	O00193	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62	3e-7	■■■□□ 15
RALGAPB-204	ENST00000438490	CHMP2A	O43633	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZBED4	O75132	1171 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CTNNA2	P26232	953 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	INPP5B	P32019	993 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CYP2J2	P51589	502 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	TBX4	P57082	545 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ERVK-9	P63128	1117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	TTMP	Q5BVD1	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	UIMC1	Q96RL1	719 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	RAB17	Q9H0T7	212 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	MYH11	P35749	1972 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	WDR64	B1ANS9	1081 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	STAM2	O75886	525 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ECHS1	P30084	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PTEN	P60484	403 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	COG2	Q14746	738 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	USP37	Q86T82	979 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	FBXL18	Q96ME1	805 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PSMB7	Q99436	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490		H0YGN5	161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	KRIT1	O00522	736 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	PHACTR2	O75167	634 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-204	ENST00000438490	ALAS1	P13196	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms