RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 CHST13Q8NET6 341 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 DNERQ8NFT8 737 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 MORC4Q8TE76 937 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 BSNDQ8WZ55 320 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ZBTB9Q96C00 473 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 BICD1Q96G01 975 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 AP1M1Q9BXS5 423 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 GGA3Q9NZ52 723 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 RGS20O76081 388 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 PDE6CP51160 858 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 PALB2Q86YC2 1186 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 PDLIM7Q9NR12 457 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 MTA2O94776 668 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 HSPA6P17066 643 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ICAM3P32942 547 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 C1QTNF8P60827 252 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ERVK-9P63128 1117 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 STXBP2Q15833 593 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 LRRC45Q96CN5 670 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 RAB20Q9NX57 234 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 WDR90Q96KV7 1748 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SGPL1O95470 568 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 FGGP02679 453 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SP4Q02446 784 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 STRN3Q13033 797 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SLC39A4Q6P5W5 647 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 CD302Q8IX05 232 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 TRPM4Q8TD43 1214 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 HELQQ8TDG4 1101 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SEMA4DQ92854 862 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 KCNN1Q92952 543 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ZIM3Q96PE6 472 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 RAB17Q9H0T7 212 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 FBXO40Q9UH90 709 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 COG5Q9UP83 839 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ZNF233A6NK53 670 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 A6NNZ2 444 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 FAM153BP0C7A2 387 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 LIG4P49917 911 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 GUCY2FP51841 1108 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 CDR2Q01850 454 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 EMC2Q15006 297 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 FAM153CQ494X1 144 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 KAT5Q92993 513 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ZNF302Q9NR11 478 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 CYP26A1O43174 497 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 EXTL3O43909 919 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 OATP04181 439 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 CYP11B1P15538 503 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 CHRNB2P17787 502 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 PTENP60484 403 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 GCNT1Q02742 428 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 MTERF2Q49AM1 385 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 IQCKQ8N0W5 287 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 UVRAGQ9P2Y5 699 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms