RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 SFI1A8K8P3 1242 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 K7ERI5 159 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 MBTPS2O43462 519 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC12A3P55017 1021 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPAQ15257 358 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.29■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 NRP1O14786 923 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 STX6O43752 255 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 CXCL14O95715 111 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 OR1G1P47890 313 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 DSC1Q08554 894 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 HSCBQ8IWL3 235 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 CTSAP10619 480 aa22.27■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 COASYQ13057 564 aa22.27■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.27■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.27■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC15Q8TF66 581 aa22.27■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.27■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.27■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 CD320Q9NPF0 282 aa22.27■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 SNTG2Q9NY99 539 aa22.27■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 KCND2Q9NZV8 630 aa22.27■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.27■■□□□ 1.16
ANKRD39-201ENST00000393537 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.26■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.26■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC16A4O15374 487 aa22.26■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 RECQL4O94761 1208 aa22.26■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.26■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 PLCG1P19174 1290 aa22.26■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 GRIK3Q13003 919 aa22.26■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNC3Q14003 757 aa22.26■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.26■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 MARCH5Q9NX47 278 aa22.26■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.26■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 NR1I2O75469 434 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 PLS3P13797 630 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 ARSHQ5FYA8 562 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SPECC1Q5M775 1068 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 GPBP1Q86WP2 473 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 GJD3Q8N144 294 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 GDAQ9Y2T3 454 aa22.25■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 GIT2Q14161 759 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 MCM6Q14566 821 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 USP49Q70CQ1 688 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 EPSTI1Q96J88 318 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 USP28Q96RU2 1077 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 STK39Q9UEW8 545 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 IRAK3Q9Y616 596 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIP11Q15643 1979 aa22.24■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 F8W810 466 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 SMTNP53814 917 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 ZP2Q05996 745 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPN14Q15678 1187 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 RAD54LQ92698 747 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 CASP10Q92851 521 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD39-201ENST00000393537 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms