RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 SSH1Q8WYL5 1049 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 DPF2Q92785 391 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 CEP95Q96GE4 821 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 BORCS6Q96GS4 357 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 TEKT5Q96M29 485 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADI1Q9BV57 179 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC13A1Q9BZW2 595 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 WDR26Q9H7D7 661 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 DNM3Q9UQ16 869 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 SIK3Q9Y2K2 1263 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 TESMINQ9Y4I5 508 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDGFRBP09619 1106 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 ECHS1P30084 290 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRHR1P34998 444 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 SREBF1P36956 1147 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC6A9P48067 706 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCNN1GP51170 649 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 RABGGTBP53611 331 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 HHEXQ03014 270 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 MGAT2Q10469 447 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 CSRP2Q16527 193 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPDYAQ5MJ70 313 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANKS6Q68DC2 871 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 MFSD5Q6N075 450 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 XYLT1Q86Y38 959 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANKRD35Q8N283 1001 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 MB21D1Q8N884 522 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 MDGA1Q8NFP4 955 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR7D4Q8NG98 312 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 MIEF2Q96C03 454 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 LDAHQ9H6V9 325 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 BCO1Q9HAY6 547 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPEF1Q9Y4P9 236 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 MRFAP1Q9Y605 127 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATRNL1Q5VV63 1379 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 MFAP3LO75121 409 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 GNAT2P19087 354 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACRV1P26436 265 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 PTPN7P35236 360 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 WASP42768 502 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 NEK2P51955 445 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM180AQ6UWF9 173 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 DOK3Q7L591 496 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPRED1Q7Z699 444 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 PQLC1Q8N2U9 271 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 IL17DQ8TAD2 202 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 ST8SIA2Q92186 375 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 EXTL1Q92935 676 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPR20Q99678 358 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCNH6Q9H252 994 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 EPC1Q9H2F5 836 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 SERPINB13Q9UIV8 391 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 INTUQ9ULD6 942 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 GIT1Q9Y2X7 761 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM171A2A8MVW0 826 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 CYP27B1O15528 508 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALDH1L1O75891 902 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 IPO13O94829 963 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 ENDOD1O94919 500 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 AMY1AP04745 511 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 INSRRP14616 1297 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 HK1P19367 917 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 FPR1P21462 350 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCND1P24385 295 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 EDNRBP24530 442 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 GUCY1A2P33402 732 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 FLT3LGP49771 235 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 PTTG1IPP53801 180 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 PER3P56645 1201 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms