RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362776.1

RNU6-1272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1272P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PIPSLA2A3N6 862 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LCHNA4D1U4 455 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RBP3P10745 1247 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ITGAMP11215 1152 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MGAT1P26572 445 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 APBA1Q02410 837 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MPP3Q13368 585 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SQSTM1Q13501 440 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DDB1Q16531 1140 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCDC178Q5BJE1 867 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 EPHA10Q5JZY3 1008 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ABHD17BQ5VST6 288 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 EFCAB12Q6NXP0 572 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CHTF18Q8WVB6 975 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C8orf37Q96NL8 207 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NEU1Q99519 415 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MS4A5Q9H3V2 200 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TLK1Q9UKI8 766 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZMYM3Q14202 1370 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 E9PSI1 815 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TGM5O43548 720 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TMEM127O75204 238 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ITGA10O75578 1167 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CDKL5O76039 1030 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ESRRBO95718 433 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 F2P00734 622 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CLEC2LP0C7M8 214 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FDXRP22570 491 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GPR15P49685 360 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ELLP55199 621 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MXRA7P84157 204 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DSG1Q02413 1049 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RESTQ13127 1097 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 UBE3CQ15386 1083 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PASD1Q8IV76 773 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NXPE1Q8N323 547 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MDM1Q8TC05 714 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DUSP26Q9BV47 211 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KIAA1586Q9HCI6 787 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IFT57Q9NWB7 429 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RNF181Q9P0P0 153 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MAST3O60307 1309 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PRSS38A1L453 326 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MYADML2A6NDP7 307 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TBKBP1A7MCY6 615 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ASMTLO95671 621 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FOSP01100 380 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CFIP05156 583 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MPLP40238 635 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NEK4P51957 841 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CHN2P52757 468 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MFSD14BQ5SR56 506 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SOGA3Q5TF21 947 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 OR56A1Q8NGH5 318 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZFP28Q8NHY6 868 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF480Q8WV37 535 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC9A6Q92581 669 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CEP95Q96GE4 821 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PHACTR3Q96KR7 559 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ORAI3Q9BRQ5 295 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MTFR1LQ9H019 292 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 OSBPL2Q9H1P3 480 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KANSL2Q9H9L4 492 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MGST3O14880 152 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ADCY6O43306 1168 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KDM1AO60341 852 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ITGB6P18564 788 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CANXP27824 592 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MANFP55145 182 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PHC1P78364 1004 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SCAPQ12770 1279 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BMT2Q1RMZ1 405 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GPR158Q5T848 1215 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-1272P-201ENST00000362776 AGAP9Q5VTM2 703 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-1272P-201ENST00000362776 METRNLQ641Q3 311 aa2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms