RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359253.2

CCDC197-201, Transcript of coiled-coil domain containing 197, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC197, Length 1,275 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197-201ENST00000359253 TLK2Q86UE8 772 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 RDH13Q8NBN7 331 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 RNF149Q8NC42 400 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 CCDC42Q96M95 316 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 MAP7D2Q96T17 732 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 FZD8Q9H461 694 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 TMEM8AQ9HCN3 771 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 GCNT4Q9P109 453 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 SIP14410 1827 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 A0A0B4J269 797 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 LRRC53A6NM62 1247 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 ACKR2O00590 384 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 CLDN3O15551 220 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 CLDN10P78369 228 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 CYP24A1Q07973 514 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 PSMD6Q15008 389 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 KYAT1Q16773 422 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 KRT39Q6A163 491 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 ZNF410Q86VK4 478 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 METTL13Q8N6R0 699 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 SPAG5Q96R06 1193 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 STK33Q9BYT3 514 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 SPC25Q9HBM1 224 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 MYO1AQ9UBC5 1043 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC197-201ENST00000359253 TISP43B9A030 160 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 EPHB6O15197 1021 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 ZEB2O60315 1214 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 GFPT2O94808 682 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 LCA5LO95447 670 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 PRKCBP05771 671 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 GNAT1P11488 350 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 SLC9A1P19634 815 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 MXI1P50539 228 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 GJA9P57773 515 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 SPA17Q15506 151 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 GRIK4Q16099 956 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 RNF180Q86T96 592 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 KIF18AQ8NI77 898 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 FNBP1Q96RU3 617 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 CHP1Q99653 195 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 USP27XA6NNY8 438 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 HAS3O00219 553 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 ZNF286BP0CG31 522 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 FERP16591 822 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 PRKCIP41743 596 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 STAT1P42224 750 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 MCL1Q07820 350 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 DRP2Q13474 957 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 ASIC2Q16515 512 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 CBWD6Q4V339 395 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 EPC2Q52LR7 807 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 DEF6Q9H4E7 631 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 SIX2Q9NPC8 291 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC197-201ENST00000359253 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms