RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 GLI1P08151 1106 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 MYBP10242 640 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 COL6A2P12110 1019 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 SLC5A1P13866 664 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 MTHFD2P13995 350 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 C5AR1P21730 350 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 MTNR1BP49286 362 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 SLC5A3P53794 718 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 BTKQ06187 659 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 LLGL1Q15334 1064 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 FIGNQ5HY92 759 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TOR2AQ5JU69 321 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CEP350Q5VT06 3117 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CEP68Q76N32 757 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TEX19Q8NA77 164 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 DLG3Q92796 817 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TONSLQ96HA7 1378 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 MAP6Q96JE9 813 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CCDC138Q96M89 665 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CD163L1Q9NR16 1453 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 SWAP70Q9UH65 585 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 MSRAQ9UJ68 235 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 KCNK3O14649 394 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 NBNO60934 754 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 SLC14A2Q15849 920 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 UGT8Q16880 541 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 C1orf141Q5JVX7 400 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 USP45Q70EL2 814 aa6.62□□□□□ -1.35
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CCL20-201ENST00000358813 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.62□□□□□ -1.35
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CCL20-201ENST00000358813 DENND1CQ8IV53 801 aa6.62□□□□□ -1.35
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CCL20-201ENST00000358813 MVB12AQ96EY5 273 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 RAX2Q96IS3 184 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 MAN2B1O00754 1011 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 PIP5K1CO60331 668 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 DGKIO75912 1065 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 PDCP20941 246 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TM4SF4P48230 202 aa6.61□□□□□ -1.35
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CCL20-201ENST00000358813 EPHA7Q15375 998 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 NR0B2Q15466 257 aa6.61□□□□□ -1.35
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CCL20-201ENST00000358813 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 NLRP10Q86W26 655 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 Q8N1Y9 231 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 POF1BQ8WVV4 589 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 DPF3Q92784 378 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 SGCZQ96LD1 299 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 GPR160Q9UJ42 338 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-201ENST00000358813 DSEQ9UL01 958 aa6.61□□□□□ -1.35
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