RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 TRPC6Q9Y210 931 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 NOP56O00567 594 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 KCNA1Q09470 495 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 KRT81Q14533 505 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 COG2Q14746 738 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 HGSNATQ68CP4 663 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CYP2W1Q8TAV3 490 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SLC20A1Q8WUM9 679 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SLC7A3Q8WY07 619 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ZBED8Q8IZ13 594 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.56■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 POLLQ9UGP5 575 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 NR1H3Q13133 447 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 ITGA8P53708 1063 aa16.55■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF341Q9BYN7 854 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ZWILCHQ9H900 591 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 K7ERI5 159 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 TTC17Q96AE7 1141 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 RMDN3Q96TC7 470 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ZFP69BQ9UJL9 534 aa16.55■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 WDR64B1ANS9 1081 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 RARGP13631 454 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ADRA2BP18089 450 aa16.55■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 TMEM117Q9H0C3 514 aa16.55■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 SGPL1O95470 568 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 PDHA1P08559 390 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 MOXD1Q6UVY6 613 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF384Q8TF68 577 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TBC1D22BQ9NU19 505 aa16.54■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 MMP10P09238 476 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CNKSR1Q969H4 720 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TTC25Q96NG3 672 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 GINS2Q9Y248 185 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 MCF2LO15068 1137 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 HHIPL2Q6UWX4 724 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 C4orf33Q8N1A6 199 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ATP2A3Q93084 1043 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TRIM55Q9BYV6 548 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TRABDQ9H4I3 376 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SPEF2Q9C093 1822 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 YWHABP31946 246 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SREBF1P36956 1147 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 RAD23BP54727 409 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SLC12A3P55017 1021 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ERP27Q96DN0 273 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ARHGEF26Q96DR7 871 aa16.53■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 YIPF3Q9GZM5 350 aa16.53■□□□□ 0.24
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PTPRU-201ENST00000345512 GYG2O15488 501 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ECE2O60344 883 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ARSEP51690 589 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 PRKG1Q13976 671 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 P3H1Q32P28 736 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CYFIP1Q7L576 1253 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF720Q7Z2F6 126 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ZBTB33Q86T24 672 aa16.53■□□□□ 0.24
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