RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 KAT5Q92993 513 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 ART4Q93070 314 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 COQ4Q9Y3A0 265 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D12O60347 775 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 ICAM1P05362 532 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 PYGMP11217 842 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 RARGP13631 454 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 COILP38432 576 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 PTGER2P43116 358 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 QARSP47897 775 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 FMO1Q01740 532 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 SLC29A2Q14542 456 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 CNTNAP1P78357 1384 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 ADRB2P07550 413 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 GHRP10912 638 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 MFAP3P55082 362 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 MDM1Q8TC05 714 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 COL20A1Q9P218 1284 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 YDJCA8MPS7 323 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 MFSD5Q6N075 450 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 CPLX4Q7Z7G2 160 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 HVCN1Q96D96 273 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 NUP85Q9BW27 656 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 SEMA4AQ9H3S1 761 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 PASKQ96RG2 1323 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 CHN1P15882 459 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 CDR2Q01850 454 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 TKFCQ3LXA3 575 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 MAEAQ7L5Y9 396 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 IL31RAQ8NI17 732 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 KDM4CQ9H3R0 1056 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC19Q9H756 370 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 EP400Q96L91 3159 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 ASAP2O43150 1006 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 CYP26A1O43174 497 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 RIPK2O43353 540 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 GPC3P51654 580 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 SLC47A2Q86VL8 602 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 C4orf19Q8IY42 314 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 CCT6BQ92526 530 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 CNKSR1Q969H4 720 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 AZI2Q9H6S1 392 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 BCS1LQ9Y276 419 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD1-201ENST00000331462 MMEP08473 750 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 RARAP10276 462 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 YWHABP31946 246 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 RWDD2BP57060 319 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 HELQQ8TDG4 1101 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 CLEC4DQ8WXI8 215 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 YY1AP1Q9H869 796 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 SLC40A1Q9NP59 571 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 DNM1LO00429 736 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 SPOPO43791 374 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 CYP11B1P15538 503 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 CAP2P40123 477 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 SPRED3Q2MJR0 410 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 FKBP1CQ5VVH2 108 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 KRT39Q6A163 491 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 PPM1KQ8N3J5 372 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 SEMA4DQ92854 862 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF653Q96CK0 615 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM8AQ9HCN3 771 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 KLC4Q9NSK0 619 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D22BQ9NU19 505 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 EXOC7Q9UPT5 735 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 BACH1O14867 736 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 MNAT1P51948 309 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 ENPEPQ07075 957 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 SPP2Q13103 211 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms