RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 TMEM119Q4V9L6 283 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 DUPD1Q68J44 220 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CPNE8Q86YQ8 564 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CTAGE3PQ8IX95 158 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 RARGP13631 454 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 MMP13P45452 471 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CPA2P48052 419 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PRELID2Q8N945 189 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PGM2Q96G03 612 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CD209Q9NNX6 404 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ICA1Q05084 483 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CFAP157Q5JU67 520 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 KAT5Q92993 513 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ZSWIM1Q9BR11 485 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 SCOCQ9UIL1 159 aa16.34■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ANKRD63C9JTQ0 380 aa16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 M0R2N6 131 aa16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 GNAT1P11488 350 aa16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CD58P19256 250 aa16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 EPHB2P29323 1055 aa16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 SLC8A3P57103 927 aa16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 IZUMO3Q5VZ72 239 aa16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 C16orf86Q6ZW13 317 aa16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ANKMY2Q8IV38 441 aa16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 HES6Q96HZ4 224 aa16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 RMDN2Q96LZ7 410 aa16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 KCTD10Q9H3F6 313 aa16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 GLI3P10071 1580 aa16.33■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 MYH7BA7E2Y1 1941 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 TISP43B9A030 160 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 FGRP09769 529 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 RARAP10276 462 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 CDR2Q01850 454 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 SPARCL1Q14515 664 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 FITM2Q8N6M3 262 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 ATP8B4Q8TF62 1192 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 RILPQ96NA2 401 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 PFASO15067 1338 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 GYG2O15488 501 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 C21orf2O43822 256 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 IRX4P78413 519 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 LRRC36Q1X8D7 754 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 ZCWPW2Q504Y3 356 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 ISLR2Q6UXK2 745 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 IRAK4Q9NWZ3 460 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 ZFATQ9P243 1243 aa16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 UBR2Q8IWV8 1755 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 OPHN1O60890 802 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 SGPL1O95470 568 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 FAM102BQ5T8I3 360 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 TTC16Q8NEE8 873 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 GRK7Q8WTQ7 553 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 SPOCK2Q92563 424 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 SGK1O00141 431 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 ENTPD5O75356 428 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 TEKT4Q8WW24 435 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 TTC17Q96AE7 1141 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 SNF8Q96H20 258 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 TTC1Q99614 292 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 ARHGAP42A6NI28 874 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 hCG_1984214I3L0E3 225 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 MAML1Q92585 1016 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa16.32■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 TNNI1P19237 187 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 CHKAP35790 457 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 KLC1Q07866 573 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 ARSHQ5FYA8 562 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 DCUN1D2Q6PH85 259 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 ZBED8Q8IZ13 594 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 DNAJC9Q8WXX5 260 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 TRABDQ9H4I3 376 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 CDH16O75309 829 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 NSFP46459 744 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 PHTF1Q9UMS5 762 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 AKAP11Q9UKA4 1901 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 GAP43P17677 238 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 FAM182AQ5T1J6 154 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 PALM2Q8IXS6 379 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 SLC5A5Q92911 643 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 TLCD1Q96CP7 247 aa16.31■□□□□ 0.2
USP25-201ENST00000285679 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms