RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 SEZ6Q53EL9 994 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 SFMBT2Q5VUG0 894 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC170Q8IYT3 715 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 EHBP1Q8NDI1 1231 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF516Q92618 1163 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R16BQ96T49 567 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR88Q9GZN0 384 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 C2orf40Q9H1Z8 148 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPRHQ9HD43 1115 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 TFR2Q9UP52 801 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A087WZ62 844 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 MYADML2A6NDP7 307 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF233A6NK53 670 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 HAS3O00219 553 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 P4HA2O15460 535 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 TOM1L1O75674 476 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 PROZP22891 400 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 POU5F1BQ06416 359 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 RAPGEF1Q13905 1077 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 TFDP1Q14186 410 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 SEMA4DQ92854 862 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 MSTO1Q9BUK6 570 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF186Q9NXI6 227 aa10.15□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 VGLL3A8MV65 326 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 ACKR2O00590 384 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 AKR1A1P14550 325 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 MXI1P50539 228 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAM17P78536 824 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 SP3Q02447 781 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 CFHR5Q9BXR6 569 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA1586Q9HCI6 787 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 LZTFL1Q9NQ48 299 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 APEX2Q9UBZ4 518 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 COQ4Q9Y3A0 265 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPRJQ12913 1337 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 UQCRHLA0A096LP55 91 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 RCCD1A6NED2 376 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 CLDN3O15551 220 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 LCA5LO95447 670 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 UQCRHP07919 91 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 DLATP10515 647 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 CPT1AP50416 773 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP27A1Q02318 531 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 ENPEPQ07075 957 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 MFSD10Q14728 455 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMD6Q15008 389 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 AMHR2Q16671 573 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC42Q96M95 316 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 PDE11AQ9HCR9 933 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 AKT3Q9Y243 479 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 TRPA1O75762 1119 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPING1P05155 500 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFSF9P41273 254 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 KIF11P52732 1056 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 CHMP4BP1P59074 171 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 ETF1P62495 437 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 ARID5AQ03989 594 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 MCL1Q07820 350 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 NFRKBQ6P4R8 1299 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 SV2AQ7L0J3 742 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 TSC1Q92574 1164 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 AP5M1Q9H0R1 490 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM8AQ9HCN3 771 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJC12Q9UKB3 198 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 MYO6Q9UM54 1294 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 NRCAMQ92823 1304 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 TMOD1P28289 359 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 HTRA3P83110 453 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 PURAQ00577 322 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT39Q6A163 491 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms