RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 ACSBG2Q5FVE4 666 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 RNF207Q6ZRF8 634 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 SPATA24Q86W54 205 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 NCAPG2Q86XI2 1143 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 SLC44A5Q8NCS7 719 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 JDP2Q8WYK2 163 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CEP63Q96MT8 703 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 TXLNGYQ9BZA5 131 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CLDN3O15551 220 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 SLC37A4O43826 429 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ZBED4O75132 1171 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CIB2O75838 187 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 LMNB1P20700 586 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 PIK3CAP42336 1068 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 C4orf50Q6ZRC1 276 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGAP18Q8N392 663 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 NID2Q14112 1375 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 MROH5Q6ZUA9 1318 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 EXOC3O60645 756 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 GCNT3O95395 438 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 PSMG1O95456 288 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 BAG3O95817 575 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 LYNP07948 512 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 PGM1P36871 562 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 COILP38432 576 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM62Q0P6H9 643 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 MTM1Q13496 603 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC174Q6PII3 467 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 MAP7D3Q8IWC1 876 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ANKLE1Q8NAG6 615 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 BARHL2Q9NY43 387 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJC12Q9UKB3 198 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ABCB11O95342 1321 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 PIAS1O75925 651 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 USP1O94782 785 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 IMPDH2P12268 514 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 COMTP21964 271 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CASP4P49662 377 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ITGA8P53708 1063 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 BTKQ06187 659 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 SH2D4BQ5SQS7 431 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 BRINP3Q76B58 766 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 PIGSQ96S52 555 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 HEMGNQ9BXL5 484 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 RMI1Q9H9A7 625 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 POTEB3A0JP26 581 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGAP42A6NI28 874 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 SFI1A8K8P3 1242 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 POTECB2RU33 542 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC22O60826 627 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 STK10O94804 968 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 DDB1Q16531 1140 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 Q4G0T1 1027 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 POTEBQ6S5H4 581 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 VGLL2Q8N8G2 317 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 INPP5DQ92835 1189 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CLMNQ96JQ2 1002 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 HEY2Q9UBP5 337 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 PRKAG3Q9UGI9 489 aa12.15□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 MYH4Q9Y623 1939 aa12.15□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 CDH16O75309 829 aa12.15□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 STARD3NLO95772 234 aa12.15□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 PLA2G4BP0C869 781 aa12.15□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 CYP2J2P51589 502 aa12.15□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 UBE2SQ16763 222 aa12.15□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 CAVIN4Q5BKX8 364 aa12.15□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 CPNE8Q86YQ8 564 aa12.15□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ARL10Q8N8L6 244 aa12.15□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 NRG4Q8WWG1 115 aa12.15□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 FNBP1Q96RU3 617 aa12.15□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 TRABDQ9H4I3 376 aa12.15□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa12.15□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ATRNO75882 1429 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 PGM3O95394 542 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 FTLP02792 175 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 PYGMP11217 842 aa12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 EIF6P56537 245 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SPDYCQ5MJ68 293 aa12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms