RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 CENPKQ9BS16 269 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 TXLNGYQ9BZA5 131 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 CCDC169A6NNP5 214 aa23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 AGTP01019 485 aa23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 KLK7P49862 253 aa23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 PSMD7P51665 324 aa23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 OXCT1P55809 520 aa23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 MAP7Q14244 749 aa23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 MEI1Q5TIA1 1274 aa23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 RSPH1Q8WYR4 309 aa23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 INPP5DQ92835 1189 aa23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 CHMP2BQ9UQN3 213 aa23.45■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 BUB1O43683 1085 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 BCRP11274 1271 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 JAG1P78504 1218 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 CNGA2Q16280 664 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 LIN52Q52LA3 116 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ESYT2A0FGR8 921 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 GDF11O95390 407 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 SPATA31D3P0C874 917 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 PRCPP42785 496 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 P3H1Q32P28 736 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 LRRC8CQ8TDW0 803 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 TBCKQ8TEA7 893 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 SEC14L1Q92503 715 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 SMC6Q96SB8 1091 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ETNK2Q9NVF9 386 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 A0A0J9YVX5 310 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 USP17L10C9JJH3 530 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 IFNAR2P48551 515 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 CROCCP2Q86T23 111 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 CATSPER2Q96P56 530 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ERGIC2Q96RQ1 377 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.342e-7■■■□□ 16.9
PITX1-201ENST00000265340 TRPV5Q9NQA5 729 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 CLRN2A0PK11 232 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 EDIL3O43854 480 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 VCAM1P19320 739 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 DLGAP5Q15398 846 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 MICALL2Q8IY33 904 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 OLFM3Q96PB7 478 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 RAD21O60216 631 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 PALMO75781 387 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ADSSL1Q8N142 457 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 LRRC15Q8TF66 581 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa23.43■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 H0Y3Z8 333 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 CCNFP41002 786 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 CD97P48960 835 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 HPCAP84074 193 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 KLC3Q6P597 504 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 NEK8Q86SG6 692 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 TRIM49BA6NDI0 452 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 DAPK3O43293 454 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 SPDYE6P0CI01 402 aa23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 SUPT3HO75486 399 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ACVR2BQ13705 512 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 SNX30Q5VWJ9 437 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 PLIN2Q99541 437 aa23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms