RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 TTC39CQ8N584 583 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM51Q9BSJ1 452 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 AK9Q5TCS8 1911 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 RAD51CO43502 376 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 CYP11B2P19099 503 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 LRRC14Q15048 493 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 JADE1Q6IE81 842 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 ZBED8Q8IZ13 594 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 ATP11CQ8NB49 1132 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 NUDCD1Q96RS6 583 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 M0QYV0 167 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 FOXP2O15409 715 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 TAP1Q03518 808 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 USP38Q8NB14 1042 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 FAM151AQ8WW52 585 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 MROH1Q8NDA8 1641 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 GOLGA8CPA6NN73 597 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 PHF2O75151 1096 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 PEX19P40855 299 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 BCAR1P56945 870 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 PSD3Q9NYI0 1048 aa18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 FGFR4P22455 802 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 MUM1L1Q5H9M0 696 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 DSTYKQ6XUX3 929 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 SLC30A5Q8TAD4 765 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 LRGUKQ96M69 825 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 LRRC37BQ96QE4 947 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 JCADQ9P266 1359 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 STAT4Q14765 748 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 SRLQ86TD4 932 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 PPM1NQ8N819 430 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 ZNRF3Q9ULT6 936 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 AGTP01019 485 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 HMGCS2P54868 508 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 TTLL4Q14679 1199 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 ADGRA1Q86SQ6 560 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 EPN3Q9H201 632 aa18.71■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 COG2Q14746 738 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 KIF22Q14807 665 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 ICE2Q659A1 982 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 RNF139Q8WU17 664 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 NR3C2P08235 984 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 STAT5BP51692 787 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 CENPPQ6IPU0 288 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 TEX13BQ9BXU2 312 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 ALG6Q9Y672 507 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 GYG2O15488 501 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 CEP120Q8N960 986 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 CCT8L2Q96SF2 557 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 MXRA8Q9BRK3 442 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 NWD1Q149M9 1564 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 A0A087X0T9 212 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 P4HA2O15460 535 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 FAM228BP0C875 321 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 TRAIPQ9BWF2 469 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 FUT8Q9BYC5 575 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 INTUQ9ULD6 942 aa18.7■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 SALL1Q9NSC2 1324 aa18.69■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 ARSEP51690 589 aa18.69■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 BEST2Q8NFU1 509 aa18.69■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 HUS1O60921 280 aa18.69■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 CIITAP33076 1130 aa18.69■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 MTMR2Q13614 643 aa18.69■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 WDR93Q6P2C0 686 aa18.69■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 RNF149Q8NC42 400 aa18.69■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 GRAMD1AQ96CP6 724 aa18.69■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 PNKPQ96T60 521 aa18.69■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 NAGPAQ9UK23 515 aa18.69■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 ATP8B3O60423 1300 aa18.69■□□□□ 0.58
SCARB2-201ENST00000264896 TTC4O95801 387 aa18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms