RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 LRRC14Q15048 493 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 LONRF1Q17RB8 773 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 EPC2Q52LR7 807 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 DAW1Q8N136 415 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 MORC4Q8TE76 937 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 TBC1D31Q96DN5 1066 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 DONSONQ9NYP3 566 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 KCND2Q9NZV8 630 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.03■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 TP73O15350 636 aa16.02■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 GAS7O60861 476 aa16.02■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 HIP1RO75146 1068 aa16.02■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 UBOX5O94941 541 aa16.02■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CLTAP09496 248 aa16.02■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 GCLMP48507 274 aa16.02■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 VAMP7P51809 220 aa16.02■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 RIPK1Q13546 671 aa16.02■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 MYBPC2Q14324 1141 aa16.02■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.02■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.02■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 AAASQ9NRG9 546 aa16.02■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 PRR12Q9ULL5 1215 aa16.02■□□□□ 0.16
SYP-201ENST00000263233 CREB1P16220 341 aa16.02■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 UBXN2AP68543 259 aa16.02■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 JAG1P78504 1218 aa16.02■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ABCB5Q2M3G0 1257 aa16.02■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 MIGA2Q7L4E1 593 aa16.02■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 VTI1AQ96AJ9 217 aa16.02■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ZDHHC15Q96MV8 337 aa16.02■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 UNC45AQ9H3U1 944 aa16.02■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ACP6Q9NPH0 428 aa16.02■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 HOMER3Q9NSC5 361 aa16.02■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 GGT7Q9UJ14 662 aa16.02■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 SPOPO43791 374 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ECEL1O95672 775 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CFBP00751 764 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 MUTP22033 750 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CETN1Q12798 172 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ACCSLQ4AC99 568 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 RNF207Q6ZRF8 634 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 OTUD6AQ7L8S5 288 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 MGARPQ8TDB4 240 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 NUP85Q9BW27 656 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 LRRC19Q9H756 370 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 SUFUQ9UMX1 484 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 TCP11X1B4DZS4 312 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 K7ENM7 598 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 P4HA2O15460 535 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ACSL3O95573 720 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 GZMAP12544 262 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 NCALDP61601 193 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CALCOCO2Q13137 446 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 VSTM1Q6UX27 236 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 DYDC1Q8WWB3 177 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa16.01■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 TMEM120BA0PK00 339 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 KCNJ2P63252 427 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 GALNTL6Q49A17 601 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 FAM71AQ8IYT1 594 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CBWD1Q9BRT8 395 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 LXNQ9BS40 222 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 A0A1W2PRG0 241 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ARHGEF35A5YM69 484 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CYP1A2P05177 515 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 ARP10275 920 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 DLATP10515 647 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 NQO1P15559 274 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 CHKAP35790 457 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 RWDD2BP57060 319 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 FMO1Q01740 532 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 LLGL1Q15334 1064 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 RHBDF2Q6PJF5 856 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 MAEAQ7L5Y9 396 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 DEFB132Q7Z7B7 95 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 SLC47A2Q86VL8 602 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 MIEF2Q96C03 454 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa16■□□□□ 0.15
SYP-201ENST00000263233 SERPINB12Q96P63 405 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms