RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 AZI2Q9H6S1 392 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 ABCB6Q9NP58 842 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 LRRN2O75325 713 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 SASH3O75995 380 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 PSMD6Q15008 389 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM143Q96AN5 459 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 NT5C1BQ96P26 610 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 RAB20Q9NX57 234 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 KIF4AO95239 1232 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 PLA2G4AP47712 749 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 HADHBP55084 474 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 C2orf54Q08AI8 447 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 K7ERI5 159 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 CXCR5P32302 372 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 Q3C1V9 767 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 UBXN6Q9BZV1 441 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 SLC26A2P50443 739 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 GCNT1Q02742 428 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 SV2AQ7L0J3 742 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 HELQQ8TDG4 1101 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 SEMA4DQ92854 862 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 ISCUQ9H1K1 167 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD9-201ENST00000249499 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 GZMAP12544 262 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 ERVK-9P63128 1117 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 IER5Q5VY09 327 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 RHOT2Q8IXI1 618 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 PPM1KQ8N3J5 372 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 TCP11Q8WWU5 503 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 KREMEN1Q96MU8 473 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 PSMB7Q99436 277 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 GPR20Q99678 358 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 ASB14A6NK59 587 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 ADCY3O60266 1144 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 EFNA5P52803 228 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 LY6KQ17RY6 165 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 TAS1R2Q8TE23 839 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC62Q6P9F0 684 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 ZPBP2Q6X784 338 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 PEX26Q7Z412 305 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 EPS8L1Q8TE68 723 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 ATP8B4Q8TF62 1192 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 ARIH2O95376 493 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 PGK2P07205 417 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 ACTRT1Q8TDG2 376 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 FNBP1Q96RU3 617 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 NOP56O00567 594 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 RTN2O75298 545 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 DLATP10515 647 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 TNFRSF8P28908 595 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 GJA5P36382 358 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 CCNA1P78396 465 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 GPS2Q13227 327 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 VIPAS39Q9H9C1 493 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 A0A0B4J269 797 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 FAM193AP78312 1265 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 CAPSQ13938 189 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 ZACNQ401N2 412 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 EEPD1Q7L9B9 569 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 NT5DC3Q86UY8 548 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 HES6Q96HZ4 224 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 AMFRQ9UKV5 643 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 TTLL4Q14679 1199 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 SMYD5Q6GMV2 418 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 DAAM2Q86T65 1068 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXD9-201ENST00000249499 USP38Q8NB14 1042 aa24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms